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有机分子构型与空间结构本课件旨在介绍有机分子的构型和空间结构,并探讨其在有机化学中的重要性什么是有机分子构型定义主要方面有机分子构型是指有机分子中原子在空间排列的方式,它决定了构型包括键角、键长、构象等,它与分子的物理和化学性质密切分子的形状和性质相关有机分子构型的重要性性质决定反应性影响构型决定了分子的极性、沸点、构型影响分子的反应性,例如影熔点、溶解度等物理性质响反应速度和产物的立体化学生物活性相关构型与药物活性、酶活性等生物活性密切相关简单有机分子的构型甲烷水四面体构型,四个氢原子位于正形构型,两个氢原子和一个氧原V四面体的四个顶点子位于同一平面上,形成一个度的夹角
104.5氨三角锥形构型,三个氢原子和一个氮原子位于同一平面上,形成一个107度的夹角烷烃分子的构型链状烷烃环状烷烃碳原子以单键连接形成直链或支链结碳原子形成闭合环状结构,通常以椅“构,主要以锯齿形构象存在式或船式构象存在“””“”烯烃分子的构型碳碳双键1碳原子之间的双键是平面结构,四个原子处于同一平面上顺式和反式2由于双键的限制,取代基在双键两侧的相对位置不同,形成顺式和反式异构体炔烃分子的构型碳碳叁键碳原子之间的叁键是直线结构,所有原子处于同一直线上线性结构由于叁键的限制,炔烃分子通常呈线性结构环状烃的构型环己烷1椅式构象能量最低,最稳定,船式构象能量较高环戊烷2包络式构象能量最低,最稳定,扭曲式构象能量较高其他环状烃3环烷烃的构型取决于环的大小和取代基的种类取代基的空间安排空间效应1取代基在分子中的空间位置会影响分子的形状和性质位阻效应2当取代基体积较大时,会产生位阻效应,影响分子构型电子效应3取代基的电子效应会影响分子中电子云的分布,进而影响分子构型立体异构12定义类型立体异构是指具有相同分子式和原子包括顺反异构、对映异构和非对映异连接顺序,但原子在空间排列方式不构等同的异构体顺式和反式异构顺式异构反式异构两个相同取代基位于双键同侧两个相同取代基位于双键两侧手性碳原子和手性分子手性碳原子手性分子连接四个不同取代基的碳原子被称为手性碳原子含有手性碳原子的分子被称为手性分子,它具有镜像异构体结构异构定义类型结构异构是指具有相同分子式,包括链状异构、位置异构、官能但原子连接顺序不同的异构体团异构等构型的表示方法投影式Fischer1将手性碳原子置于中心,垂直和水平线分别代表手性碳原子的键投影式Newman2将手性碳原子投影到纸面上,观察前后键的相对位置楔形破折号投影式-3使用楔形和破折号分别表示指向观察者和背离观察者的键分子建模软件的使用软件种类常用的分子建模软件包括、、ChemDraw GaussViewSpartan等功能这些软件可以构建分子模型、模拟分子性质、预测反应产物等从模型到实际分子结构模型局限性分子模型是真实分子结构的简化,无法完全反映真实分子1实验验证2需要通过实验方法验证分子模型的准确性不断完善3随着实验技术的进步,分子模型不断完善,更接近于真实分子结构分子间相互作用力范德华力1包括伦敦色散力、偶极偶极力、偶极诱导力等--氢键2氢原子与高电负性原子(如氧、氮)形成的特殊相互作用力离子键3由带相反电荷的离子通过静电吸引形成的化学键分子间相互作用的影响12物理性质化学反应影响物质的熔点、沸点、溶解度等物影响化学反应速度、产物选择性等化理性质学反应过程3生物活性影响药物活性、酶活性等生物活性氢键及其在有机化学中的应用水分子结构DNA水分子之间形成氢键,使水具有高沸点和高表面张力双螺旋结构中的碱基配对是通过氢键实现的DNA分子间范德华力伦敦色散力偶极偶极力-所有分子之间都存在的相互作用力,由瞬时偶极的相互诱导产生极性分子之间存在的相互作用力,由永久偶极的相互吸引产生分子的电性质电负性偶极矩原子吸引电子的能力,影响分子衡量分子极性的指标,表示分子中电荷的分布中正负电荷中心的距离和大小分子形状与极性12对称分子不对称分子具有对称结构的分子通常是非极性的,例如甲烷具有不对称结构的分子通常是极性的,例如水分子形状与理论价键理论通过原子轨道重叠来解释化学键的形成,可以预测分子形状分子轨道理论通过原子轨道的线性组合来解释化学键的形成,可以解释分子性质分子形状预测方法理论VSEPR1通过电子对之间的相互排斥来预测分子形状价键理论2根据原子轨道的重叠方式来预测分子形状分子轨道理论3通过分子轨道的能量和形状来预测分子形状空间构型与生物活性药物分子1药物分子与靶点之间的相互作用通常是通过空间构型来实现的酶活性2酶的活性与其三维空间结构密切相关,构型改变会影响酶活性生物活性3许多生物活性分子,如激素、抗生素等,其活性与其空间构型密切相关构型对药物活性的影响12靶点结合活性差异药物分子与靶点之间的相互作用需要不同的构型可能导致药物活性不同,匹配的构型甚至失效3药效学研究药效学研究关注药物分子与靶点之间的相互作用,与构型密切相关结构优化与活性提高计算机模拟合成方法通过计算机模拟优化药物分子结构,提高药物活性根据优化后的构型,设计新的合成方法,合成具有更高活性的药物分子总结与展望重要性研究方向有机分子构型和空间结构对分子性质和功能至关重要未来的研究方向包括更精确的模型构建、更先进的计算方法、以及新功能材料的设计实践与应用药物设计材料科学通过优化药物分子构型,提高药设计具有特定形状和性质的材料物活性,减少副作用,用于新材料的开发环境科学研究污染物分子结构,用于环境污染的治理课后思考题问题11如何用不同的方法表示分子的构型?问题22如何利用分子建模软件进行构型分析?问题33构型对分子性质和功能有何影响?参考文献参考文献参考文献12有机化学,第八版,有机化学,第五版,Paula KennethL.著著Yurkanis BruiceWilliamson。
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