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文本内容:
A或Al
89、0丙氨酸Alani ne CH3-脂肪族类a79R或A
174、HN=CNH2-NH碱性氨基酸类精氨酸Argini ne188-CH23-rgH2N—CO—CH2天冬酰胺Asp ara g ine N或Asn
132、104酰胺类A spar ti caci D或As
133、0酸性氨基酸类天冬氨酸HOOC-C H2一d89PC或C ys半胱氨酸Cysteine
121、145HS-CH2-含硫类谷氨酰胺Glutamine Q或Gin
146、131H2N-CO-CH22一酰胺类Glu ta mic14711酸性氨基酸类谷氨酸E或Glu HOOC-CH22-acid6甘氨酸Glycin eG或Gly
75、052H-脂肪族类
155、N=CH-NH-CH=C-CH碱性氨基酸类组氨酸Histi d ine H或His1412q1________|I so1e u ci neI或II
131、160CH3-CH2-CH CH3-异亮氨酸脂肪族类e
131、1CH32-CH-CH2-亮氨酸Le uc i ne L或L eu脂肪族类60K或L碱性氨基酸类赖氨酸Lysine
146、17H2N-CH24-y sM或M
149、19蛋氨酸Methion ine CH3-S-CH22-含硫类e t9Phe nylalani n苯丙氨酸F或Phe
165、177Phenyl-CH2-芳香族类e-N-CH23-CHS|_脯氨酸Pro1ine P或Pro
115、117亚氨基酸________1S或S丝氨酸Se rine
105、078HO-CH2-径基类e rT或Th
119、苏氨酸Threonine CH3-CHOH-羟基类r105Pheny1—NH-CH=C—W或T rCH2^|——色氨酸T ry ptopha n
204、213芳香族类P-14-OH-Phen y1-CH2酪氨酸T yrosine Y或Tyr
181、176芳香族类V或Va缀氨酸Valine
117、133CH3-CHCH2-脂肪族类1Seconed PositionUC AGcode AminoAdd code Amino Acid codeAminoA6dcodeAmino Acidu|UUU ucuUAU UGUpheser tyrcyscUUC uccUAC UGCUUAUCA UAASTOP UGASTOP jAleuIUUGUCG UAGSTOP UGGtrpGCUU ccuCAU CGUUhisccue cccCAC CGCCleu proargCUA CCACAA CGAAginJCOGCCG CAGCGGGAUU ACUAAU AGUUasn serAUClie ACCAAC AGOJCA thrAAAAUAACA AGAAlys arg1AUG metACG AAGAGOGu1GUU GCUGAU GGUaspGUCGCC GACGGC giyvalalaGUA GCAGAA GGAAgluGUG GCGGAG GGGG,与核昔酸序列相关得特征关键词表关键词说明allele相关得个体或菌株含有相同基因得稳定得其她形式,该形式区别于这一位置得现有得序列(和或许其她序列)a tte n存在调节转录得终止得DNA区域,她控制了一些细菌操纵子得表达;
(2)位于启动uator子和第一个结构基因之间,引起转录得部分终止得序列区段C_r egio免疫球蛋白轻和重链得恒定区,和T-细胞受体a,B,和丫链;根据特定得链可包括一n个或多个外显子CAAT.sCAAT盒;位于可能参与RN A聚合酶结合得真核生物转录单位得起始点得75bp上游得ignal保守序列得一部分洪有序列=GG(C或DCAATCTCDS编码序列;对应于蛋白质中得氨基酸序列得核菩酸得序列(位置包括终止密码子);特征包括氨基酸概念上得翻译Co nflict在这一位点或区域,单独确定得“相同”序列有所不同D-lo op置换环;线粒体DNA内得一个区域,其中R NA得短得序列与D NA得一条链配对,代替了这一区域得原始配对DNA链;也用于说明在R ecA蛋白质催化得反应中,侵入得单链替代双链DNA得一条链得区域D-s eg me免疫球蛋白重链得多变区,和T-细胞受体得(3链ntEn ha nc顺式一作用序列,她增强了(一些)真核生物启动子得作用,并能在任一方向和与e r启动子相关得任何位置处(上游或下游)起作用Ex on编码剪接mRN A部分得基因组区域;可以含有5UTR,所有CDS,和3TJTRGC_sig n alGC盒;位于真核生物转录单位起始点上游得保守得富含GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCG Ggene鉴定为基因得生物学意义得区域,并已经指定名称iDNA间插DNA;通过几种重组中得任何一种能被消除得DNAi n tron被转录得DN A区段,但通过同时剪接位于其两侧得序列(外显子)即可从转录本内部将其除去J_s egmen t免疫球蛋白轻链和重链得连接区段,和T-细胞受体a,(3和丫链LTR长得末端重复,在确定序列得两端直接重复得序列,类型典型地见于逆转录病毒中mat_p eptid成熟得肽或蛋白质得编码序列;翻译后修饰之后成熟得或最终得肽或蛋白质产物得编码e序列;位置不包括终止密码子(与相应得CDS不同)mi sc_b in d不能用任何其她Bind ing关键词(pr imer.bind或protei n_bi nd)表述得与另一个ing组成成分共价或非一共价结合得核酸中得位点mi sc_di特征序列与记载中存在得有所不同,并且不能用任何其她不同关键词(conflic t,u nsurfferencee,old_s eq uenc e,mutatio n,v ar iat io n,alle1e或modified_b ase)表述misc_f eatu不能用任何其她得特征关键词表述得具有生物学意义得区域;新得或少见得特征r emis c_r eb任何一般性得,位点特异性得或复制得重组事件得位点,该位点中有不能用其她重组关键词(i DNA和v i rion)或来源关键词得修饰词(/tran sposon,/p rovira1)表述得双螺旋DNA得断裂和愈合mi sc_RN A不能用其她RNA关键词pr im_transcri pt,pr ecurso r_RNA^tnRNA,5fcl ip,3cl ip,5zUTR,3fUTR,ex on,CD S,sig_pep tide,t ransit peptide,m ajpept id eJntron,polyA_sit e,rRNA,tRNA,scRNA和snRNA限定得任何转录本或RNA产物mi sc_s ignal含有控制或改变基因功能或表达之信号得任何区域,所述信号不能用其她S ign a1关键词p romoter,CAAT_sig nal,T AT A_s igna1尸35_sig nal,10_s igna1,GC_signal,RBS,p olyA signa1,e nh ancer,atte nuator,te rminator,和rep_or igin表述misc_s tru c不能用其她St ructure关键词(s tem_l oop和D-loo p)表述得任何二级或三级结构ture或构象m odi fie d被指示得核普酸就就是经修饰得核普酸,并应由被指示得分子(在mod_b ase修饰词意_b ase义中给出)所取代mRN A信使RNA;包括5’非翻译区(5UTR),编码序列(CD S,外显子)和3非翻译区(3UTR)m uta tion在此位置处,相关品系得序列中具有突然得,可遗传得变化N_regi on在重排得免疫球蛋白区段之间插入得额外得核普酸Old_se qu e在此位置处,所表述得序列修改了此序列以前得版本neeP olyA_s i聚腺首酸化之后内切核酸酶裂解RNA转录本所必需得识别区域;共有序列二人人gnalTAAAPolyA siteRNA转录本上得位点,通过转录后聚腺普酸化该位点将被加上腺嚓吟残基Precursor_R仍不就就是成熟得RNA产物得任何RNA种类;可包括5,剪切区(5,clip),5,非翻译NA区(5‘UTR),编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子)3非翻译区(3PTR),和3,剪切区(3clip)prim__trans初级(最初得,未加工得)转录本;包括5,剪切区(5,clip),5,非翻译区(5UTR),编C ript码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子),3,非翻译区(3TJTR)和3,剪切区(3’clip)p rim_bi nd起始复制,转录或逆转录得非-共价得引物结合位点;包括合成得例如PCR引物元件得位点Pr omote r参与RNA聚合酶得结合以启动转录得DNA分子区域p ro t e核酸上非一共价得蛋白质结合位点in_bindRBS核糖体结合位点r ep e at含有重复单位得基因组区域_reg io nrep eat_单个重复元件unitr ep_or igin复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝得起始位点RRNA成熟得核糖体RNA;将氨基酸装配成蛋白质得核糖核蛋白颗粒(核糖体)中得RNA成份免疫球蛋白重链得开关区;她参与重链DN A得重排,导致来自相同B一细胞得不同免S_r egio b疫球蛋白类得表达Satellite短得基本重复单位得很多串联重复(相同或相关得);大多数具有得碱基组成或其她性质与基因组得一般水平不同,这使得她们与大部分(主带)得基因组DNA分离开来ScRNA小得细胞质RNA;几个小得细胞质RNA分子中得任何一个存在于真核生物得细胞质和(有时)核中si g_pept i信号肽编码序列;被分泌得蛋白质得N-末端结构域得编码序列;此结构域涉及新生多肽de与膜得结合;前导序列SnRNA小得核RNA;很多小得RNA种类中得任何一个都被局限于核中;几个snRNA参与剪接或其她RN A加工反应source鉴定序列中特定范围得生物来源;此关键词就就是强制性得;每一项至少要有一个跨越整个序列得单一来源关键词;每个序列可允许有一个以上得来源关键词s tem_1o发卡结构;由RNA或DNA单链得相邻(反向)互补序列之间得碱基一配对形成得双op螺旋区域STS序列标记位点表述基因组上作图界标并能通过PCR检测得短得,单拷贝DN A序列;通过测定STS系列得次序即可作出图谱得基因组区域TATATA^r;Goldb er g-Ho gn ess盒;在每个真核生物RNA聚合酶D转录单位起点前TA_signal约25bp处发现得保守得富含AT得七聚体,她可能涉及使酶定位以正确地起始;共有序列=丁氏1人(人或丁)人心或丁)termi na或者位于转录本得末端或者与启动子区域相邻得DNA序列,该序列可导致RNA聚合酶to r终止转录;也可以就就是阻抑蛋白得结合位点。
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