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使用教程PubMed欢迎参加PubMed使用教程培训,这是当今最全面的医学文献检索数据库指南PubMed包含超过2600万条生物医学文献记录,是医学研究人员必不可少的工具本教程将全面介绍PubMed数据库的功能和使用方法,内容涵盖来自70多个国家5,200余种期刊的资源我们将基于2025年最新界面与功能进行讲解,帮助您掌握文献检索的核心技能课程概述PubMed简介与基本概念深入了解PubMed的发展历史、数据来源及基础框架,建立对这一平台的整体认识检索策略与方法详解掌握基本检索技巧、关键词选择和布尔运算符使用方法,提高文献查找的准确性和效率高级搜索技巧与过滤器使用学习构建复杂检索式、使用MeSH主题词和应用各种过滤器,实现精确定位所需文献结果管理与文献获取方式了解文献保存、导出和全文获取的多种途径,建立个人文献资料库个人账户管理与定制功能第一部分概述PubMed美国国立医学图书馆NLM开发的免费医学文献数据库作为世界上最大的医学图书馆创建的公共资源,PubMed为全球研究人员提供开放获取的医学知识平台MEDLINE数据库的网络版本基于传统MEDLINE数据库开发的网络检索系统,提供更便捷的访问方式和功能扩展涵盖1950年至今的医学文献记录拥有七十余年的历史文献资源,可追溯现代医学发展的完整脉络每日更新,确保最新研究成果收录范围PubMed环境医学与营养卫生学基础医学与临床医学研究关注环境因素对健康的影响和营养科学研包括解剖学、生理学、病理学及各临床专科究,为公共卫生决策提供科学依据研究,覆盖从基础理论到临床应用的完整医学知识体系职业病学与卫生管理涵盖职业暴露相关疾病研究和医疗卫生系统管理,促进职业安全和医疗体系优化医疗保健与社会医学微生物学与药学研究整合医疗服务研究和社会因素分析,推动医疗公平和健康政策制定收录病原微生物研究和药物开发相关文献,支持传染病防控和药物研发数据来源PubMed多源整合数据平台汇聚多个专业文献数据库资源《Index toDental Literature》牙科文献收录口腔医学和牙科专业资源《International NursingIndex》护理文献整合全球护理学研究成果《Index Medicus》临床医学文献核心医学期刊资源库PubMed通过整合这些专业索引资源,建立了全面的生物医学文献检索系统除了上述核心数据来源外,PubMed还收录了大量其他生命科学领域期刊文献,包括生物化学、分子生物学、生物技术等相关研究成果,形成了覆盖面广泛的综合性医学文献库界面概述PubMed主页搜索框与功能区介绍导航菜单与工具栏说明中央搜索框提供快速检索入口,周围布局高级功能链接检索框支持自顶部导航栏提供PubMed各主要功能区的快速切换,包括高级检索、然语言输入,系统自动解析关键词并匹配合适的主题词搜索框下方设MeSH数据库、期刊数据库等核心功能模块右侧工具栏集成个人账户有常用功能快捷入口,便于直接访问高频使用的工具访问、帮助文档和系统设置等辅助功能,优化用户体验结果页面布局与筛选面板个人账户区域与设置选项检索结果页采用三栏设计,左侧为筛选面板,中间显示文献列表,右侧右上角个人中心区域提供MyNCBI账户登录入口,登录后可访问保存的提供相关资源链接筛选面板包含多维度过滤选项,支持按发表时间、检索历史、文献集合和个性化设置系统设置支持界面语言切换、每页文献类型、物种等属性精确筛选目标文献显示结果数量调整和排序方式自定义等多项个性化配置功能特点PubMed免费访问,全球可用无需付费订阅,打破地域限制智能词语匹配与纠错理解用户意图,提供精准结果多样检索方法与策略满足不同复杂度的查询需求强大的结果精炼工具精确定位目标文献资源PubMed的这些核心功能特点使其成为全球医学研究人员首选的文献检索平台系统设计充分考虑了用户体验,即使是检索经验有限的新手用户也能快速上手同时,丰富的高级功能又能满足专业研究人员对精确检索的需求,实现了易用性与专业性的完美平衡第二部分基本检索方法简单关键词检索最基础的检索方式,直接输入研究主题相关词汇,系统自动匹配相关文献适合初步了解研究领域或检索思路不明确的情况使用字段限定检索通过字段标签限制检索范围,提高检索精确度常用字段包括题名、作者、期刊等,能够在特定信息域内进行定向检索布尔逻辑运算符使用使用AND、OR、NOT等逻辑运算符组合多个检索条件,构建复杂检索式,精确控制检索结果范围截词符与通配符检索利用星号等通配符匹配词根变体,一次检索捕获同一词根的不同形式,扩大检索覆盖面简单关键词检索1直接在搜索框输入关键词在PubMed主页的中央搜索框中输入研究主题相关词汇,可以是单个词、短语或完整句子,系统会自动处理并执行检索输入时无需考虑特殊格式要求,使用自然语言表达即可2PubMed自动词语转换匹配功能系统会自动分析输入的词语,将其与医学主题词表MeSH进行匹配,识别专业术语并转换为标准检索词,提高检索效率这种自动术语映射功能是PubMed的重要特色3系统自动扩展相关词汇PubMed会自动将检索词扩展到相关同义词、近义词和变体形式,确保检索结果的全面性例如,检索heart attack时,系统会自动包含myocardial infarction相关文献4结果按相关性进行排序检索结果默认按照与检索词的相关性排序,匹配度高的文献排在前列用户也可以切换为按发表时间排序,优先显示最新研究成果检索示例关键词搜索检索词检索结果数量系统转换处理心肌梗塞myocardial infarction约243,000篇匹配Myocardial Infarction[MeSH]和相关词条2型糖尿病治疗type2diabetes treatment约168,000篇组合Diabetes Mellitus,Type2[MeSH]和therapy[Subheading]新冠肺炎中药治疗COVID-19traditional Chinese约2,800篇组合COVID-19[MeSH]和Medicine,Chinesemedicine Traditional[MeSH]以上示例展示了不同复杂度的关键词检索情况可以观察到,针对常见疾病如心肌梗塞的检索结果数量较大,需要进一步精炼;而对于更具体的复合概念如新冠肺炎中药治疗,检索结果数量相对较少,但精确度更高PubMed的自动词语转换功能为用户省去了手动查找主题词的步骤,大大简化了检索流程,同时保持了较好的检索效果这使得即使没有专业检索背景的用户也能获得有价值的检索结果字段限定检索题名字段限定作者字段限定期刊字段限定使用[Title]或[TI]标签限定关键词仅在文使用[Author]或[AU]标签查找特定研究使用[Journal]或[TA]标签限定在特定期章题名中出现,适用于查找主题非常明者的发表成果,可以跟踪学者的研究方刊范围内检索,了解权威期刊的最新研确的文献向和成果究动态示例diabetes[Title]仅检索题名中示例Wang J[Author]检索姓Wang示例Science[Journal]仅检索在包含糖尿病的文献名以J开头的作者论文《科学》杂志发表的论文字段限定检索通过明确指定关键词出现的位置,能够有效提高检索的精确度PubMed支持30多种检索字段,包括机构地址[Affiliation]、出版日期[Date]、语言[Language]等,为用户提供多维度的精准检索选择字段限定检索示例题名中包含肝癌特定作者的论文特定期刊发表的论文中国作者论文检索式Liver检索式Wang检索式Cancer[Title]J[Author]检索式Cell[Journal]China[Affiliation]直接定位以肝癌为主题的查找由Wang J发表的所限定只检索在Cell期刊发查找机构所在地为中国的文献,排除仅在正文中提有文献,适用于追踪特定表的文献,便于了解该顶研究团队发表的论文,可及肝癌的文章,提高检索研究者的学术成果或查找级期刊的最新研究进展和用于了解国内研究水平和结果的针对性已知作者的相关论文热点方向关注方向布尔逻辑运算符AND运算符OR运算符用于组合两个检索条件,要求检索结果同时满足这两个条件使用AND可以用于检索满足任一条件的文献,扩大检索范围适用于使用同义词或相关概缩小检索范围,提高检索精确度例如,hypertension AND diabetes念进行检索例如,cancer ORtumor ORneoplasm将检索包含任一肿将只检索同时讨论高血压和糖尿病的文献瘤相关术语的文献,提高召回率NOT运算符运算符优先级与括号分组用于排除特定条件,从检索结果中剔除不需要的内容例如,cancer NOT多个运算符组合使用时,PubMed从左到右依次处理使用括号可以改变默lung将检索讨论癌症但不涉及肺癌的文献使用NOT需谨慎,避免意外排认运算顺序,明确表达复杂的逻辑关系例如,cancer ORtumor AND除相关内容therapy与cancer ORtumor ANDtherapy的检索结果不同布尔运算符示例心脏病AND糖尿病肺炎OR肺部感染复杂组合检索检索式heart diseaseANDdiabetes检索式pneumonia ORlung infection检索式cancer ORtumor ANDtherapyNOT surgery检索同时讨论心脏病和糖尿病关系的文检索讨论肺炎或肺部感染任一主题的文献,适用于研究这两种疾病共病机制或相献,扩大了检索范围,确保不会遗漏使用检索讨论癌症或肿瘤治疗但不涉及手术方互影响此检索范围较窄,但结果相关性不同术语描述的相关研究法的文献通过括号明确表达了癌症或肿高瘤作为一个整体概念,然后与治疗相结合,同时排除手术相关内容截词符与通配符星号*作为通配符星号可以代表任意数量的字符,放置在词根后面用于匹配该词根的所有变体形式这种检索方法能够一次性涵盖同一概念的不同表达方式,提高检索的全面性词根检索的优势使用词根加截词符的方式可以同时检索单复数形式、不同时态和词性变化的词汇,避免因词形变化导致的遗漏这在英语医学文献检索中尤为有用,能大幅提高检索效率PubMed中的使用限制在PubMed中,截词符只能放在词根末尾,不支持前缀通配符检索此外,系统对于过短词根少于4个字符的截词检索可能会自动禁用,以避免返回过多不相关结果使用建议截词符最适合用于检索具有多种词形变化的术语,但过度使用可能导致检索结果过于宽泛建议在特定情况下有针对性地应用,而非作为常规检索手段截词符使用示例toxic*检索范例neuro*检索范例immun*检索范例使用检索式toxic*使用检索式neuro*使用检索式immun*•匹配toxic有毒的•匹配neurology神经学•匹配immune免疫的•匹配toxicity毒性•匹配neuroscience神经科学•匹配immunity免疫力•匹配toxicology毒理学•匹配neurosurgery神经外科•匹配immunology免疫学•匹配toxication中毒•匹配neurotransmitter神经递质•匹配immunization免疫接种•匹配toxicologist毒理学家•匹配neuroimaging神经影像学•匹配immunodeficiency免疫缺陷适用于全面检索与毒性相关的各类研适合检索神经系统相关的多学科研究,用于免疫学领域的全面文献检索,涵盖究,无需分别输入多个相关词汇一次囊括多个专业领域基础研究和临床应用多个方面第三部分高级检索功能Advanced Search界面使用高级检索界面提供结构化检索选项,允许用户通过表单方式构建复杂检索式界面包含多个检索字段选择框、逻辑运算符选择和检索限制条件设置区域,使复杂检索变得直观简便检索历史与检索式构建检索历史功能记录当前会话中执行的所有检索操作,用户可以查看每次检索的检索式和结果数量这些历史记录可以通过编号引用,组合构建更复杂的检索策略检索结果的组合与精炼通过对检索历史中的结果应用布尔运算符,可以实现检索结果的组合、交集和排除这种分步骤检索的方法使得复杂检索更加可控和透明,便于调整检索策略限定检索与过滤器应用高级界面提供丰富的限定选项,如文献类型、发表时间、语言、物种等用户可以结合使用这些过滤器,快速缩小检索范围,找到最符合要求的文献资源界面Advanced SearchPubMed高级搜索界面位于主页顶部的Advanced链接,点击后进入功能完备的高级检索页面界面包含三个主要区域上部的查询构建器Query Builder,用于逐步构建检索式;中部的检索历史Search History,显示当前会话的所有检索记录;下部的检索限制选项,提供各类过滤条件高级搜索界面适合构建精确的检索策略,特别是对于复杂的研究问题,能够提供更有针对性的检索结果这一功能主要面向专业研究人员和情报检索工作者使用,需要对PubMed的检索字段和功能有一定了解构建复杂检索策略明确研究问题定义清晰的研究问题和检索目标,识别关键概念和术语例如研究2型糖尿病患者中二甲双胍对心血管风险的影响,可分解为2型糖尿病、二甲双胍和心血管风险三个核心概念拆分概念与同义词扩展为每个核心概念列出可能的同义词、相关术语和MeSH主题词,例如二甲双胍可扩展为metformin、glucophage等商品名,心血管风险可扩展为具体的心血管事件类型分步构建检索式先对每个概念单独进行检索,评估结果数量和相关性,然后使用检索历史中的编号和布尔运算符组合这些结果例如#1AND#2AND#3表示三个概念的交集应用限制条件根据研究需要,添加文献类型、发表时间、语言等限制条件,进一步精炼检索结果例如限定近五年发表的随机对照试验,可大幅提高检索效率检索历史功能当前会话检索记录检索历史自动保存当前浏览会话中执行的所有检索操作,包括检索式、执行时间和结果数量这些记录在浏览器会话期间保持可用,关闭浏览器后将清除检索编号引用系统每条检索记录会自动分配一个序号#1,#2,#
3...,这些编号可以在后续检索中引用例如,可以使用#1AND#2来查找两个检索结果的交集,无需重新输入完整检索式检索式修改与优化用户可以选择历史记录中的任一检索式进行编辑和修改,调整检索策略或扩展检索范围系统提供Add tobuilder功能,可将历史记录中的检索式添加到查询构建器中进行修改检索历史的保存与共享登录MyNCBI账户后,可以永久保存检索历史策略,为其命名并添加描述保存的检索策略可在未来快速调用,也可以设置定期自动运行并发送更新提醒,还能与合作者共享完整检索方案限定检索与过滤器PubMed提供多种过滤器帮助用户缩小检索范围,这些过滤器可以在检索结果页面左侧边栏直接应用,也可以在高级检索界面预先设置文献类型过滤器允许用户指定特定的发表形式,如临床试验、系统评价或实验研究等时间范围过滤器可限定特定年份或时间段内发表的文献,尤其适合追踪最新研究进展语言限制过滤器可以筛选特定语言的文献,对于只能阅读特定语言的研究者很有帮助物种限制过滤器可区分人体研究和动物实验,对于临床研究人员尤为重要全文可获取性过滤器可以筛选出可免费获取全文的文献,解决全文获取障碍,提高文献利用效率常用过滤器设置5常用时间范围最近五年发表的论文是许多研究者的首选时间范围,它平衡了文献的时效性和数量PubMed提供多个预设时间选项,包括1年、5年、10年等,也支持自定义日期范围6核心临床过滤器PubMed提供六种核心临床过滤器,包括治疗、诊断、病因、预后、临床预测指南和临床试验,帮助临床医生快速找到实用的循证医学证据9主要文献类型常用的文献类型过滤器包括随机对照试验RCT、系统评价、荟萃分析、临床指南等九种类型,这些代表了不同层级的医学证据2全文可得性选项PubMed提供两个全文可得性过滤器Free fulltext免费全文和Full text可通过机构订阅获取的全文,帮助研究者优先查看可直接获取的文献第四部分主题词检索MeSHMeSH概念介绍主题词数据库使用MeSH是美国国立医学图书馆创建的医通过MeSH数据库查找并选择准确的检学主题词表系统,提供标准化的医学术索词,了解词条间的层级关系和范围,语体系,作为PubMed索引的基础提高检索的准确性应用副主题词构建检索策略通过添加副主题词限定主题词的特定方将选定的MeSH主题词组合进检索式,面,如诊断、治疗或流行病学,进一步可以显著提高检索结果的相关性和准确精细化检索范围性,减少噪音主题词系统MeSH层级结构体系从广泛到具体的分类系统标准化医学术语统一医学概念表达方式年度更新机制反映医学领域最新发展全面医学概念覆盖涵盖所有医学研究领域MeSHMedical SubjectHeadings主题词系统是PubMed文献索引的核心,它提供了一套统一的术语标准,解决了医学概念表达多样性带来的检索困难MeSH系统采用树状层级结构,主题词从广泛到具体逐层细分,每个主题词都有唯一的树状编号例如,心血管疾病作为一个大类,下设心脏病、血管疾病等子类,再进一步细分到具体疾病MeSH系统每年更新一次,以反映医学科学的最新发展和术语变化2025年版MeSH共包含超过30,000个主题词和80多个副主题词,为精确医学文献检索提供了强大支持使用MeSH主题词检索是提高检索精确度的重要方法,特别适合系统性文献综述等需要高度全面性和精确性的检索任务主题词数据库MeSH访问路径MeSH数据库可通过PubMed主页顶部导航菜单的MeSH Database链接进入,或直接访问https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh进入后,用户可在搜索框中输入医学概念,系统会返回相关的MeSH主题词条目词条信息展示每个MeSH主题词条目包含详细信息,包括词条定义、首次引入年份、同义词列表、在层级树中的位置以及可用的副主题词这些信息帮助用户理解主题词的准确含义和适用范围,选择最合适的检索词层级结构浏览系统提供主题词层级结构的可视化浏览功能,用户可以查看当前主题词的上位词更广泛概念和下位词更具体概念这种层级关系展示有助于调整检索范围,在需要时扩大或缩小检索面主题词选择与添加用户可以选择合适的主题词,添加到检索构建器中系统允许同时选择多个主题词,并使用布尔运算符组合它们此外,用户可以选择是否爆炸Explode主题词,即同时包含其所有下位词进行检索主题词检索步骤MeSH确定研究概念明确研究问题中的核心概念,考虑可能的医学术语表达方式例如,研究哮喘患者吸入激素治疗,核心概念包括哮喘、吸入激素和治疗在MeSH数据库中查找主题词进入MeSH数据库,输入核心概念相关词汇,查看系统返回的主题词选项仔细阅读主题词定义和范围说明,确保选择的主题词准确匹配研究概念选择主题词与副主题词选中最合适的主题词,根据需要添加副主题词以限定特定方面例如,为哮喘添加drug therapy副主题词,聚焦药物治疗研究构建检索式点击Add tosearch builder将选中的主题词添加到检索构建器中重复上述步骤添加其他概念的主题词,并使用布尔运算符将它们组合成完整检索式执行检索并评估结果点击Search PubMed按钮执行检索,评估结果数量和相关性根据需要调整检索策略,可能包括添加或移除主题词、修改布尔运算符或调整副主题词检索示例MeSH糖尿病并发症检索心脏病诊断方法检索药物不良反应检索检索式Diabetes检索式Heart检索式Drug-Related SideEffects andComplications[Mesh]Diseases/diagnosis[Mesh]Adverse Reactions[Mesh]此检索使用MeSH主题词直接查找与糖尿病并这个检索组合了Heart Diseases主题词和使用专门的药物不良反应MeSH主题词进行检发症相关的研究,结果约49,000篇文献相diagnosis副主题词,专门检索心脏病诊断索,结果约113,000篇文献这比使用drug比使用关键词diabetes方法相关研究,结果约92,000篇文献这种side effects等自然语言词汇更准确,因为complications文本词检索,MeSH检索方法能精确定位特定疾病的特定方面研究,大它使用了PubMed的标准索引术语,确保检能够排除仅在文中提及但不以并发症为主题的大减少不相关结果索结果的一致性和全面性文献,提高结果精确度副主题词应用副主题词英文标识适用情况诊断/diagnosis研究疾病诊断方法、技术或标准治疗/therapy研究疾病治疗方案、效果或指南病理/pathology研究疾病病理生理机制或特征流行病学/epidemiology研究疾病发病率、流行趋势或分布副作用/adverse effects研究治疗方法或药物的不良反应副主题词Subheadings是附加在MeSH主题词后的限定词,用于限定所查询主题的特定方面在PubMed中,共有80多个副主题词可用,它们可以显著提高检索的精确性例如,对于Hypertension高血压这一主题词,添加不同的副主题词可以将检索焦点限定在不同方面/drug therapy聚焦药物治疗,/surgery聚焦手术治疗,/complications聚焦并发症使用副主题词的格式为主题词/副主题词,如Asthma/genetics表示哮喘的遗传学研究一个主题词可以同时使用多个副主题词,形式为主题词/副主题词1/副主题词2副主题词的选择应当根据研究问题的具体需求,合理使用可以显著降低检索噪音,提高检索效率第五部分检索结果管理检索结果显示与排序PubMed提供多种结果显示格式和排序选项,用户可以根据需要选择最合适的查看方式默认的摘要格式展示基本文献信息,而详细格式则包含更多元数据排序选项包括最新发表、最佳匹配和作者姓名等多种方式文献摘要与全文获取检索结果页面提供摘要浏览和全文链接功能,用户可以快速评估文献相关性并获取全文PubMed集成了多种全文获取渠道,包括出版商网站、PMC开放获取库和机构图书馆链接器导出与保存检索结果PubMed支持将检索结果导出为多种格式,便于参考文献管理和后续使用用户可以选择导出为多种文献管理软件兼容格式,或简单的文本和电子表格格式,满足不同需求创建文献集合与参考文献列表通过MyNCBI账户功能,用户可以创建和管理个人文献集合,为不同研究项目分类整理相关文献系统还支持生成标准格式的参考文献列表,简化引用和参考文献管理过程检索结果界面默认显示摘要格式Summary检索结果默认以摘要格式显示,每条结果包含标题、作者、期刊名称、发表日期和PubMedID等基本信息这种简洁的展示方式有助于快速浏览大量检索结果,识别潜在相关文献其他显示格式选项系统提供多种显示格式选项,可通过Format下拉菜单切换Abstract格式增加显示文章摘要内容;MEDLINE格式以标签字段方式显示完整书目信息;Summary格式简洁展示核心信息;PubMed格式提供最全面的元数据结果排序选项默认排序为Most Recent最近发表,将最新文献排在前面,便于了解研究前沿BestMatch最佳匹配排序基于复杂算法计算文献与检索词的相关度,将最相关文献排在前面其他排序选项包括第一作者、期刊和标题等每页显示条目数设置用户可以调整每页显示的文献数量,默认为10条,可选择
20、
50、100或200条对于大量检索结果,增加每页显示数量可以减少翻页操作,提高浏览效率;但显示数量过大可能导致页面加载速度变慢文献摘要与全文获取摘要信息详解全文获取途径点击检索结果中的文献标题,进入详细摘要页面,可查看完整的PubMed提供多种全文获取渠道,主要通过摘要页右上角的文献信息摘要页包含标题、作者信息、机构单位、摘要内容、Full TextLinks按钮访问这些链接可能指向出版商网站、MeSH主题词和出版信息等此外,还显示DOI、PMID等唯一标PMC开放获取库或机构订阅资源对于开放获取文章,会显示识符,便于文献引用和跟踪明显的Free PMCArticle或Free Article标识许多文献还提供图表预览和附加材料链接,有助于快速评估文献如果没有直接全文链接或无法访问出版商资源,用户可以尝试以内容的相关性和价值部分文献还会显示相关文献和引用数据,下替代方式使用机构图书馆的链接解析服务;通过便于拓展阅读和了解文献影响力ResearchGate或Academia等学术社交平台联系作者;利用图书馆馆际互借或文献传递服务;查找预印本服务器如bioRxiv上的版本文献导出与引用格式选择需要导出的文献在检索结果页面,通过勾选文献前的复选框选择需要导出的条目可以选择当前页面的部分或全部文献,也可以点击All results选择所有检索结果上限1000条选择完成后,系统会显示已选文献数量选择导出方式点击页面上方的Send to下拉菜单,选择合适的导出方式选项包括Citationmanager引文管理器格式、File文件保存、Collections添加到个人收藏、Email发送电子邮件和Clipboard临时剪贴板等不同选项适用于不同的使用场景和后续处理需求指定导出格式选择导出格式,PubMed支持多种标准格式,包括MEDLINE完整字段标记、PubMed标准引用格式、PMID List仅ID列表、Abstract含摘要文本、CSV电子表格兼容格式等对于引文管理需求,还支持RIS和BibTeX等专用格式完成导出操作根据选择的导出方式执行最终操作若选择文件保存,指定文件名和保存位置;若选择邮件发送,输入接收邮箱地址;若导出到引文管理器,系统会生成兼容格式文件供下载导入导出完成后,可根据需要将文献导入EndNote、Zotero或Mendeley等文献管理软件创建文献集合12注册与登录MyNCBI创建新集合使用文献集合功能首先需要注册MyNCBI账户,点击PubMed页面右登录后,选择检索结果中希望保存的文献,点击Send to菜单中的上角的Sign in链接,选择使用NCBI账户、谷歌账户或机构账户登录Collections选项系统会提示选择已有集合或创建新集合创建新首次使用需要填写基本信息并设置偏好,完成后即可使用个性化功能集合时需输入集合名称和可选的描述信息,建议使用具有描述性的名称以便于区分不同研究主题34管理文献集合共享与协作功能可通过页面顶部My NCBI链接访问个人集合管理页面在此可以重MyNCBI支持集合共享功能,可以生成集合的公开URL链接,分享给同命名集合、添加描述、合并集合或删除不需要的集合系统还允许为事或合作者还可以设置集合为公开或私有,以及是否允许他人添加集合添加标签,便于分类和快速定位特定主题的文献集评论这使得团队协作文献管理成为可能,特别适合多人参与的系统评价或研究项目第六部分个性化设置与高级功能创建个人账户利用MyNCBI功能个性化研究体验设置自动提醒跟踪研究领域的最新进展订阅期刊更新及时获取核心期刊最新文章自定义过滤器创建专属检索筛选条件PubMed的个性化功能极大地提升了研究效率,使文献检索和管理更加智能化通过这些功能,研究者不必重复执行相同的检索步骤,系统会自动追踪研究兴趣领域的最新发展同时,个性化设置也使得检索结果展示更加符合个人需求,减少了筛选不相关信息的时间成本这些高级功能特别适合长期从事特定领域研究的专业人员,能够构建个性化的文献监测系统,确保不会错过领域内的重要进展随着人工智能技术的发展,PubMed的个性化推荐功能还将进一步完善,提供更加精准的文献推送服务账户MyNCBI账户注册与设置检索历史管理文献集合与书目MyNCBI账户完全免费,支持多登录状态下,系统可以永久保存MyNCBI允许创建多个文献集种注册方式,包括电子邮箱注检索历史和检索策略,而非仅限合,将检索结果分类整理,便于册、机构账号关联和第三方账号于当前浏览会话保存的检索策不同项目或主题的文献管理用如Google账号登录首次登录略可以命名、添加描述和标签,户可以为每个集合设置权限,选后,用户可以设置个人偏好,包方便日后快速找回和重复执行择私有、公开或仅分享给特定人括界面语言、默认显示格式和邮这对于复杂检索或需要定期更新员系统还支持导出标准格式的件通知频率等的系统评价特别有用参考文献列表个性化界面设置用户可以自定义PubMed界面显示,包括默认过滤器、排序方式、每页显示结果数量等还可以设置检索结果的高亮显示规则,让重要信息如关键词或特定作者更易于识别,提高浏览效率检索提醒服务保存检索策略首先需要构建并执行满意的检索式,获得符合预期的检索结果然后点击Createalert按钮保存该检索策略,为其命名并添加描述,便于日后识别不同的检索提醒设置更新频率选择检索自动运行的频率,可选项包括每天、每周或每月根据研究领域更新速度和个人需求选择合适的频率,热门研究领域可能需要更频繁的更新,冷门领域则可以降低频率配置通知方式设置接收更新结果的方式,默认为电子邮件通知可以指定接收通知的邮箱地址,设置电子邮件格式HTML或纯文本,以及是否包含摘要内容还可选择接收所有新结果或仅接收符合特定条件的结果管理提醒服务在MyNCBI账户的Saved Searches部分可以查看和管理所有保存的检索提醒用户可以随时修改提醒设置,包括更新频率、通知方式或检索式本身也可以暂停或删除不再需要的提醒服务期刊目录更新服务期刊新刊提醒功能设置期刊提醒步骤PubMed提供期刊目录更新服务Journal Tableof
1.在PubMed主页点击Journals链接访问期刊数据库Contents,允许用户订阅特定期刊的新刊提醒这项服务会
2.搜索并找到需要订阅的期刊在选定期刊发布新一期内容时自动发送通知,包含该期所有文章
3.点击期刊名称进入详情页的基本信息
4.选择Create alert选项这项功能特别适合研究者关注领域内的核心期刊,确保第一时间
5.设置提醒频率和接收方式了解权威刊物发布的最新研究成果对于掌握研究前沿动态和及
6.确认订阅设置时跟进学术发展至关重要用户可以根据个人需求订阅多本期刊,并在MyNCBI账户的Saved Searches部分统一管理所有期刊提醒自定义过滤器创建个性化过滤器MyNCBI允许用户创建自定义过滤器,这些过滤器可以应用于任何检索结果,实现一键筛选自定义过滤器本质上是预先定义的检索策略,可以包含各种限定条件的组合,如特定的文献类型、研究设计、主题领域或期刊范围过滤器设计策略设计有效的过滤器需要明确研究重点和常用的限定条件例如,临床医生可以创建高质量临床证据过滤器,组合RCT、系统评价和META分析等文献类型;特定专科医生可以创建仅包含其专业领域期刊的过滤器,快速锁定核心文献过滤器创建步骤登录MyNCBI,进入NCBI SitePreferences,选择FiltersIcons设置点击AddCustom Filter,输入过滤器名称和描述在Query Builder中构建过滤器检索式,可以使用任何有效的PubMed检索语法保存设置后,自定义过滤器会出现在检索结果的过滤器面板中过滤器共享与应用创建的自定义过滤器可以在机构内部共享,促进团队协作和检索标准统一机构信息专员可以为不同科室设计专属过滤器,提高整体文献检索效率在日常检索中,只需点击过滤器名称即可应用,无需重复输入复杂的限定条件第七部分功能扩展PubMedNCBI整合生物医学数据体系PMC全文资源库PubMed与其他NCBI数据库的无缝连免费获取大量开放获取文献全文,支持接,形成完整的生物医学信息生态系统全文检索和深度阅读精确文献定位工具临床查询专用工具通过已知部分信息快速定位特定文献,为医疗实践设计的专业检索工具,快速解决引用查找需求找到循证医学证据相关数据库NCBI美国国家生物技术信息中心NCBI维护着一系列相互关联的生物医学数据库,PubMed只是这个庞大生物信息生态系统的一部分这些数据库之间建立了深度连接,使用户可以从文献检索无缝切换到基因、蛋白质、结构或临床数据的浏览例如,检索某种疾病的PubMed文献时,系统会提供相关的基因信息链接;查看基因数据时,又可以直接访问相关的蛋白质结构或变异信息主要相关数据库包括PubMed CentralPMC提供免费全文访问;Gene数据库包含各物种基因信息;Protein数据库收录蛋白质序列数据;OMIM数据库专注人类遗传疾病信息这种整合式设计极大地促进了从基础研究到临床应用的知识转化,为生物医学研究提供了全方位的信息支持研究人员可以利用这一系统追踪从基因发现到临床应用的完整研究链条全文数据库PMC万700+免费全文文献数量PMC数据库收录超过700万篇可免费获取的全文文献,是全球最大的生物医学开放获取资源库之一这些文献多来自开放获取期刊和符合NIH公共获取政策的资助研究成果9000+参与期刊数量目前有超过9000种期刊向PMC提供全文内容,包括完全开放获取期刊和部分内容开放的混合模式期刊这些期刊需要满足PMC的内容和技术质量标准才能加入收录计划万1000+月均访问量PMC每月服务全球超过1000万次用户访问,提供超过3000万次全文下载这一庞大用户群体包括研究人员、医疗专业人员、教育工作者和公众,体现了科学信息开放共享的重要价值20+使用年限自2000年建立以来,PMC已运行超过20年,成为生物医学领域开放获取运动的标志性平台其文献归档遵循严格的数字保存标准,确保长期可访问性和内容完整性临床查询Clinical Queries临床研究类别适用情境检索策略特点治疗Therapy查找干预措施效果评估研究优先筛选RCT和临床试验诊断Diagnosis寻找诊断测试准确性研究筛选灵敏度和特异度评估研究病因Etiology确定疾病危险因素或原因优先筛选队列和病例对照研究预后Prognosis了解疾病自然过程和结局筛选前瞻性队列研究临床预测Clinical寻找预测模型和决策工具筛选预测规则和风险评分系Prediction统Clinical Queries是PubMed专为临床医生设计的特殊检索工具,可通过主页导航菜单或直接访问https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/clinical/进入该工具使用经过验证的方法学过滤器,能快速识别高质量的临床研究证据,避免检索结果中充斥低质量研究工具界面简洁明了,包含三个主要检索区域临床研究类别检索、系统评价检索和医学遗传学检索用户可选择检索范围的宽窄broad/narrow,在召回率和精确度之间取得平衡宽泛检索会找到更多相关文献但可能包含不相关结果,而精确检索结果较少但相关性更高Single CitationMatcher工具功能与定位使用方法与技巧Single CitationMatcher单篇文献匹配器是一种专用工具,访问路径从PubMed主页点击Single CitationMatcher用于根据已知的部分文献信息快速定位特定文章当用户知道文链接,或直接访问专用界面界面提供多个字段供填写已知信献的部分信息如作者姓名、部分题名、发表期刊或年份但不清息,包括期刊名称、卷期页码、作者姓名、文章题名和发表日期楚完整引用信息时,这一工具特别有用等用户无需填写所有字段,只需提供已知的部分信息它的主要应用场景包括查找参考文献中引用的文章;验证不完•期刊字段支持部分名称和缩写,系统会自动匹配整或可能有错误的文献信息;根据研讨会或讲座中提到的文献线•作者字段建议使用姓氏加首字母,如Smith J索查找原始文章;查找已知作者在特定期刊上发表的文章等•题名字段只需输入几个关键词,不必是完整标题•日期字段可只指定年份,无需精确到月日提供的信息越精确,匹配结果越准确如初次搜索未找到匹配结果,可尝试减少字段输入或使用更宽泛的条件第八部分检索实例与应用场景文献综述检索策略系统性文献综述需要全面覆盖特定主题的所有相关研究,要求检索策略具有高度灵敏性和全面性这类检索通常采用主题词和自由词的组合策略,应用多种同义词表达,并使用Review[PublicationType]限定文献类型临床问题检索方法临床实践中的问题检索通常采用PICO框架结构化临床问题,分别检索患者人群、干预措施、对照措施和结局指标相关文献,然后组合这些检索结果Clinical Queries工具专为此类检索设计,可快速找到高质量临床证据循证医学检索应用循证医学检索强调证据等级和质量评估,优先考虑系统评价、荟萃分析和随机对照试验等高级别证据这类检索通常使用方法学过滤器和限定检索,快速定位最佳可用证据,支持临床决策制定科研项目文献调研技巧科研立项前的文献调研需要全面了解研究现状,识别知识空白和研究机会这类检索通常从高质量综述入手,梳理研究脉络,然后追踪关键文献的引用网络,建立领域知识图谱,为创新研究设计提供依据文献综述检索策略明确综述主题范围首先需要明确综述的核心问题、研究范围和纳入标准精确定义研究问题和PICO要素,确定需要覆盖的时间范围、研究类型和语言限制等这一步对后续检索策略的制定至关重要构建全面检索词表系统性地识别与主题相关的所有可能检索词,包括MeSH主题词和自由词每个核心概念应列出同义词、近义词、缩写、常见表构建结构化检索式达变体等请教领域专家和图书馆员可获得更全面的词表使用布尔运算符组织检索词通常采用概念A AND概念B AND概念C的基本结构,每个概念内部使用OR连接同义词,如4term1OR term2AND term3OR term4针对复杂主应用方法学过滤器题,可能需要更复杂的逻辑结构根据综述类型应用适当的方法学过滤器如果是针对特定研究设计的综述,可以添加研究类型限制,如Randomized验证与记录检索策略Controlled Trial[Publication Type]或Review[Publication Type]但需注意过滤器可能导致相关测试检索策略是否能找到已知的关键文献如果有遗漏,需调整文献被错误排除策略根据PRISMA指南要求,详细记录最终检索策略,包括检索词、逻辑结构、应用的限制条件、检索日期和获得的结果数量等,确保检索过程可重复临床问题检索法PICO临床问题结构化使用PICO框架解构临床问题P-患者人群/问题明确目标人群特征和临床情境I-干预措施确定治疗方法、诊断测试或暴露因素C-对照措施指定比较的替代方案或标准治疗O-结局指标定义关注的临床结果和评价指标PICO检索法是循证医学实践中解决临床问题的标准方法,通过将问题分解为四个核心要素,形成结构化的检索策略例如,对于问题在2型糖尿病患者中,二甲双胍与磺脲类药物相比,哪种更能有效控制血糖水平?,可以明确识别P患者-2型糖尿病患者;I干预-二甲双胍;C对照-磺脲类药物;O结局-血糖控制效果实际检索时,通常先分别检索PICO四个要素,然后使用AND运算符将它们组合有时可以略去某些要素以避免过度限制检索范围,例如在初步检索时可以只使用P和I要素PICO框架不仅适用于治疗类问题,也可应用于诊断、预后、病因和预防等多种临床问题类型,是临床决策中获取最佳证据的有效工具循证医学证据检索临床指南与系统评价随机对照试验观察性研究证据循证医学证据金字塔的顶层是临床实践指南和RCT是评估干预措施效果的黄金标准,在证据当RCT不可行或不存在时,队列研究、病例对系统评价/荟萃分析,代表最高级别证据检索等级中仅次于系统评价检索RCT可使用照研究等观察性研究成为重要证据来源检索这类证据可使用Practice RandomizedControlled这类研究可使用相应的出版类型标签,如Guideline[Publication Type]或Trial[Publication Type]限定词,或在Cohort Studies[MeSH]或Case-ControlSystematic Review[Publication Type]Clinical Queries中选择Therapy类别和Studies[MeSH],也可在Clinical Queries限定词,也可利用Clinical Queries工具中的Narrow范围,系统会自动应用经过验证的方中选择Etiology或Prognosis类别找到这系统评价检索选项直接定位这类证据法学过滤器,提高检索精确度类研究科研项目文献调研技巧从综述入手了解领域全貌开始新研究项目时,首先检索近期发表的高质量综述文章,获取领域概况、研究历史和当前热点检索式可使用Review[Publication Type]AND主题词系统评价和荟萃分析提供了已有证据的系统总结,有助于识别知识空白跟踪关键作者与机构识别领域内有影响力的研究者和机构,使用作者字段限定检索他们的工作例如WangYL[Author]或Harvard[Affiliation]关注这些领军人物的最新研究方向和成果,了解前沿进展可设置作者更新提醒,及时获知其新发表文章利用引用网络扩展阅读找到核心文献后,利用引用关系扩展阅读范围向前追溯该文引用的参考文献,了解研究基础;向后查找引用该文的新研究,了解最新进展PubMed的Similar articles和Cited by功能有助于构建完整文献网络建立长期文献跟踪系统针对研究项目建立自动文献更新机制保存核心检索策略并设置定期提醒,订阅关键期刊的目录更新,关注重要会议摘要和预印本平台持续文献监测确保研究与前沿进展同步,及时调整研究方向实用技巧与常见问题检索结果过多的缩小策略检索结果过少的扩展方法当检索结果数量过大时如超过1000篇,可采用以下策略缩小范当检索结果过少或未找到相关文献时,可尝试以下扩展方法围•使用同义词、相近概念或不同表达方式,用OR连接•添加更多相关概念,使用AND运算符组合•使用截词符*匹配词根的不同变体形式•使用主题词检索替代关键词检索,并取消Explode选项•减少检索概念数量,去除非必要的AND限制•添加副主题词限定特定方面,如/therapy或/diagnosis•检查拼写是否正确,尝试词汇的不同拼写形式•限定文献发表时间为近期如5年内•扩大发表时间范围,考虑较早期的文献•应用文献类型过滤器,如临床试验或综述•使用Similar articles功能,从一篇相关文献扩展•限定研究对象为人体研究Humans中外文文献交叉检索技巧PubMed主要收录英文文献,若需同时检索中文文献,建议结合使用中国知网CNKI、万方或维普等中文数据库可先在PubMed构建英文检索策略,再将核心概念翻译成中文用于中文数据库检索注意术语翻译的准确性,必要时参考医学双语词典或MeSH中文版总结与学习资源PubMed是医学文献检索的强大工具,掌握其高效使用方法对医学研究和临床工作至关重要本教程涵盖了从基础检索到高级功能的全面内容,为不同层次用户提供了实用指导要持续提高PubMed使用技能,可利用以下学习资源NLM提供丰富的官方培训材料,包括在线视频教程、交互式学习模块和详细用户指南,访问https://www.nlm.nih.gov/training/可获取最新资源许多医学图书馆定期举办PubMed专题培训讲座和工作坊,提供个性化指导和实践机会NCBI YouTube频道发布最新功能介绍和使用技巧视频此外,PubMedHelp文档详细解释了每项功能的使用方法,是解决具体问题的实用参考。
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