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生物化学辅导课件欢迎来到生物化学辅导课程本课程将全面介绍生物化学的基础理论与核心概念,从蛋白质、核酸、糖类到脂类,系统讲解生物大分子的结构与功能,深入探讨酶学、代谢与调控等关键知识点通过本课程的学习,你将建立完整的生物化学知识体系,掌握解决实际问题的能力,为后续专业课程学习奠定坚实基础我们将结合丰富的案例、清晰的图解和互动练习,帮助你深入理解这门学科的魅力与重要性课程介绍课程概述与目标学习方法与考核本课程全面介绍生物化学基本概课程采用理论讲解与案例分析相念、理论体系与研究方法,旨在结合的方式,鼓励预习复习与小帮助学生掌握生物大分子的结构组讨论考核包括平时作业与功能,理解生命活动的分子基、实验报告和期末20%30%础,建立系统的生物化学思维考试,注重知识理解与应50%用能力专业地位与作用生物化学是生命科学的核心课程,是医学、药学、农学等专业的基础,为后续专业课程如生理学、分子生物学、免疫学等提供理论支撑,对培养专业思维至关重要第一部分绪论生物化学的定义与研究范围生物化学是研究生物体内化学物质组成、结构及其在生命活动中变化规律的科学研究范围包括生物大分子结构、代谢与调控、基因表达与调控等,探索生命现象的化学本质生物化学的发展历史从世纪末的原生质学说到现代分子生物学革命,生物化学19经历了从经验描述到分子机制解析的飞跃重要里程碑包括双螺旋结构发现、基因编码破译和蛋白质结构测定等DNA生物化学与其他学科的关系生物化学是联系化学与生物学的桥梁,与分子生物学、遗传学、细胞生物学等紧密相连现代生物化学已发展成为多学科交叉的研究领域,推动了生命科学的整体进步生物化学发展简史早期阶段世纪19年维勒合成尿素,打破了有机物只能由生物体合成的观念1828年布赫纳提取酵母提取液,证明酶促反应可在细胞外进行,奠定1897了生物化学的基础这一阶段主要特点是探索性研究与基本概念的建立分子生物学革命世纪中期20年沃森和克里克提出双螺旋结构模型,年尼伦伯格破1953DNA1961译遗传密码,年桑格开发测序技术这一时期的诺贝尔奖获1977DNA得者如克雷布斯循环、林德斯特伦朗氧化磷酸化等人的贡献推TCA-动了生物化学的飞跃发展现代生物化学世纪21人类基因组计划完成、蛋白质组学兴起、结构生物学与计算生物学发展,生物化学研究进入系统性与整合性阶段基因编辑、单细胞测CRISPR序等新技术不断涌现,推动生物化学向精准医学、合成生物学等前沿领域拓展生物化学研究方法结构分析方法解析生物大分子的精细结构是理解其功能的分离纯化技术关键主要技术包括射线晶体衍射确定蛋白质三维结构生物大分子的分离与纯化是生物化学研•X-究的基础常用方法包括核磁共振波谱分析分子动态结构•-质谱分析测定分子量与序列信息离心分离技术基于密度差异分离•-•-细胞组分功能研究手段色谱法利用分配系数差异进行分•-离探究生物分子在生命活动中的作用机制常见方法有电泳技术根据电荷与质量分离生•-物分子酶学分析研究酶促反应动力学•-基因工程改变基因表达研究功能•-代谢组学系统分析代谢网络变化•-第二部分蛋白质化学蛋白质的功能执行生物体内多种生物学功能蛋白质的结构从一级到四级的层次化结构组织氨基酸的结构与性质蛋白质的基本构建单元蛋白质是生命活动的主要承担者,在生物体内发挥着多种重要功能理解蛋白质的化学本质,首先需从其基本构建单元氨基酸开始,逐—步探索蛋白质多层次的结构特点,最终揭示结构与功能之间的密切关系蛋白质化学是生物化学的核心内容,掌握这部分知识将为理解生命活动的分子基础奠定坚实基础无论是酶催化、信号传导还是免疫防御,都离不开蛋白质的参与氨基酸的化学结构氨基酸的基本结构氨基酸的分类氨基酸是蛋白质的基本组成单位,一般由碳原子连接氨基根据基团的理化性质,种常见氨基酸可分为α--R20₂、羧基、氢原子和特异性的基团构成基团NH-COOH RR非极性氨基酸丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸等•的不同决定了种常见氨基酸的特性差异,是氨基酸多样性的20极性无电荷氨基酸丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸等化学基础•酸性氨基酸天冬氨酸、谷氨酸•在生理下,氨基酸通常以两性离子形式存在,即氨基质子化pH碱性氨基酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸•为₃⁺,羧基解离为⁻,这种特性使氨基酸具有缓-NH-COO冲作用,对维持生物体内环境的稳定性至关重要这种分类有助于理解氨基酸在蛋白质中的排布及其对蛋白质结构和功能的影响蛋白质的一级结构肽键的形成与特性氨基酸序列测定方一级结构与功能的法关系肽键是氨基酸之间通过脱水缩合形成的共价键,埃德曼降解法是测定蛋蛋白质的一级结构决定连接一个氨基酸的羧白质端氨基酸的经典了其所有高级结构的形α-N基与另一个氨基酸的方法,通过循环反应可成,进而决定其生物学α-氨基肽键具有部分双逐一确定氨基酸顺序功能序列中关键位点键特性,导致其平面性现代技术如质谱法能快的突变可能导致蛋白质和刚性,这是由于碳氮速分析肽段序列,而功能丧失或改变,如镰之间的共振效应造成的测序和基因克隆技状细胞贫血症中血红蛋DNA肽键的这些特性对蛋白术也可间接推导蛋白质白链第位谷氨酸被缬β6质高级结构的形成具有序列正确测定氨基酸氨酸替代,导致蛋白质决定性影响序列是研究蛋白质结构结构和功能异常与功能的第一步蛋白质的二级结构螺旋结构折叠结构α-β-螺旋是最常见的蛋白质二级结构之一,由单一多肽链以右手折叠是由多肽链以平行或反平行方式排列形成的片层状结构α-β-螺旋方式盘绕形成每个螺旋圈含有个氨基酸残基,螺距为相邻肽链间通过肽键与之间的氢键连接稳定折叠
3.6C=O N-Hβ-螺旋主要通过肽链中每个氨基酸的与其后第中的氨基酸基团呈上下交错排列,平行折叠的氢键呈斜线排
0.54nmα-C=O Rβ-四个氨基酸的之间形成的氢键稳定列,而反平行折叠的氢键则垂直于肽链N-Hβ-螺旋的形成受氨基酸种类影响,如脯氨酸由于其环状结构会折叠常见于丝蛋白等结构蛋白中,也是淀粉样蛋白病变中异α-β-破坏螺旋,而丙氨酸、亮氨酸等则有利于螺旋形成肌红蛋白和常蛋白聚集的主要形式二级结构的测定主要依靠圆二色谱CD血红蛋白中富含螺旋结构和傅里叶变换红外光谱等技术α-FTIR蛋白质的三级结构蛋白质折叠原理结构域与功能区域蛋白质折叠遵循热力学最低能量状态原结构域是蛋白质中独立折叠的功能单元,则,由一级结构自发形成特定三维构象通常由个氨基酸组成一个蛋50-300折叠过程涉及中间状态和多种路径,最白质可含多个结构域,各执行不同功能,终形成具有生物活性的天然构象如酶的催化域和底物结合域变性与复性稳定三级结构的力热、强酸碱、有机溶剂等因素可导致蛋多种分子间作用力共同稳定蛋白质三级白质变性某些变性蛋白在适宜条件下结构,包括疏水相互作用、氢键、离子可自发复性,证明一级结构决定高级结键、范德华力和二硫键其中疏水相互构的原理作用是主要驱动力蛋白质的四级结构2+4多亚基组成血红蛋白亚基蛋白质四级结构指两个或多个多肽链亚基通过经典的四级结构蛋白血红蛋白由个亚基组成42非共价键相互作用形成的功能性复合体,每条多个链和个链,展示了多亚基蛋白的协同作α2β肽链都具有完整的一级、二级和三级结构用机制∞调节可能性四级结构提供了更复杂的调节机制,如变构效应,使蛋白质功能可以根据环境变化精细调控蛋白质四级结构的稳定主要依靠亚基间的非共价相互作用,包括疏水作用、氢键、离子键和范德华力这些作用虽然单个较弱,但数量众多,共同提供了足够的稳定性同时,这种非共价本质也赋予了四级结构必要的可逆性,使蛋白质能够根据生理需要发生可控的构象变化典型的四级结构蛋白还包括多聚酶、抗体分子、胰岛素和病毒外壳蛋白等四级结构的研究通常采用射线晶体学、冷冻电镜和小角射线散射等技术X X蛋白质的生物学功能催化功能结构与运输功能酶是具有催化功能的蛋白质,结构蛋白如胶原蛋白、角蛋白能显著加速生化反应速率而不提供细胞和组织的机械支持;改变平衡酶的催化效率极高,运输蛋白如血红蛋白负责氧气专一性强,活性受精细调控运输,血浆白蛋白携带脂肪酸催化过程涉及活性中心与底物和药物,转铁蛋白运输铁离子结合、过渡态稳定和产物释放这类蛋白质结构特异性强,与等步骤如淀粉酶、胰蛋白酶其功能紧密相关,是维持生理等都是重要的催化蛋白稳态的重要分子基础信号传递与免疫功能激素受体蛋白识别特定激素并激活下游信号通路;蛋白偶联受体转导细G胞外信号至细胞内;抗体识别和中和外来抗原;细胞因子调节免疫反应信号蛋白通常具有高度特异性的识别区域和信号转导结构域,实现精确的信息传递第三部分酶学酶的本质与特性酶是生物催化剂,主要由蛋白质组成酶的作用机制通过降低活化能加速生化反应进行酶活性的调节多层次精细调控确保代谢平衡酶学是生物化学的重要分支,研究酶的结构、功能、催化机制及其调节作为生物催化剂,酶能使生化反应速率提高倍,10^6-10^12且具有高度的专一性和可调控性,是生命活动得以有序进行的关键本部分将系统介绍酶的基本特性、反应动力学、调节机制以及在医学和工业中的应用,帮助你理解酶促反应的本质和生物体内精密的代谢调控网络掌握酶学知识对理解正常生理功能和疾病发生机制至关重要酶的基本特性酶的化学本质酶的专一性大多数酶是蛋白质,少数为酶对底物和反应类型具有高度专一核酶作为蛋白质,酶具有性底物专一性使酶只能识别特定RNA特定的氨基酸序列和三维结构,这化学结构的底物;反应专一性则确决定了其催化特性酶分子中直接保酶只催化特定类型的化学反应参与催化反应的区域称为活性中心,这种专一性源于酶与底物之间的精通常由分散在一级结构中但在三维确构象互补,遵循锁钥模型或-空间上靠近的氨基酸残基组成诱导契合模型酶的高效催化能力酶通过降低反应的活化能加速反应进行,而自身不改变反应的平衡常数酶的催化效率极高,每个酶分子每秒可催化数百至数百万次反应酶的高效性源于其提供了有利的微环境,稳定了反应过渡态,并通过多种机制降低了反应能垒酶促反应动力学米氏方程及其意义双倒数作图与影响因素米氏方程是描述酶促反应速率与底物浓度关系的基本方程双倒数作图是米氏方程的线性变换v=Lineweaver-Burk1/v=其中为反应速率,为最大反应速该作图法可用于方便地确定Vmax[S]/Km+[S]v VmaxKm/Vmax1/[S]+1/Vmax率,为底物浓度,为米氏常数和值,横轴截距为,纵轴截距为[S]Km Km Vmax-1/Km1/Vmax值等于使反应速率达到一半时的底物浓度,反映了酶影响酶反应速率的主要因素包括Km Vmax与底物的亲和力值越小,亲和力越大取决于酶的KmVmax温度一般随温度升高而加快,但过高温度会导致酶变性•总量和转化数,转化数表示单位时间内每个酶分子催化的kcat值每种酶都有最适值,过高或过低都会影响活性底物分子数,是衡量酶催化效率的重要参数•pH pH酶浓度在底物过量情况下,反应速率与酶浓度成正比•底物浓度低浓度时近似一级反应,高浓度时趋于零级反应•酶活性的调节酶活性调节是生物体维持代谢平衡的关键机制变构效应是一种重要的调节方式,变构效应物与酶的变构位点结合,导致酶构象变化,进而影响其催化活性典型的变构酶如磷酸果糖激酶,受抑制和激活ATP AMP共价修饰是另一种重要调节方式,包括磷酸化、乙酰化、泛素化等如糖原磷酸化酶通过可逆磷酸化去磷酸化在活性和非活性状态间/转换酶抑制剂根据作用机制可分为竞争性、非竞争性和反竞争性抑制剂,它们以不同方式影响酶与底物的结合或催化过程许多药物和毒物正是通过抑制特定酶的活性发挥作用酶的分类与命名酶类催化反应类型典型代表氧化还原酶催化氧化还原反应脱氢酶、氧化酶
1.转移酶催化基团转移反应激酶、转氨酶
2.水解酶催化水解反应蛋白酶、脂肪酶
3.裂解酶催化非水解裂解反应醛缩酶、脱羧酶
4.异构酶催化分子内重排反应磷酸葡萄糖异构酶
5.连接酶催化两分子连接反应连接酶
6.DNA国际酶学委员会建立了系统的酶命名与分类体系,根据催化反应类型将酶分为六大类每种酶都有一个编号,由四组数字组成,分别表示主类别、亚类别、EC EnzymeCommission Number次亚类别和序列号酶的命名遵循两个系统一是系统名称,通常由底物名称加反应类型后缀酶组成,如葡萄糖磷酸脱氢酶;二是常用名称,往往更简短易记,如胰蛋白酶理解酶的分类体系有助于把握酶--6-的多样性和专一性,为深入学习各类酶的特性奠定基础酶在医学和工业中的应用临床诊断应用医疗与药物应用工业生产应用血清中多种酶活性可作为疾病诊断标志物酶在药物开发中既是重要靶点也是治疗工工业酶应用广泛,如淀粉酶和蛋白酶用于如血清转氨酶、升高提示肝损具如抗生素青霉素通过抑制细菌细胞壁洗涤剂提高去污能力;纤维素酶用于纺织ALT AST伤,淀粉酶和脂肪酶升高常见于胰腺炎,合成酶发挥作用;溶栓药物如链激酶、尿品加工和造纸工业;果胶酶用于果汁澄清;肌酸激酶升高见于心肌梗死现代临床检激酶通过激活纤溶酶溶解血栓;胰岛素制固定化酶技术实现酶的重复使用和连续生验中,酶联免疫吸附试验已成为剂用于糖尿病治疗;替代疗法如胰酶用于产;酶工程通过蛋白质改造创造出性能更ELISA蛋白质和抗体检测的重要方法胰腺功能不全患者优的新型酶,适应不同工业需求第四部分核酸化学核酸的生物学功能遗传信息的储存、传递与表达和的结构DNA RNA2不同核酸的独特结构特点核苷酸的结构核酸的基本构建单元核酸是生命的信息分子,承载着遗传信息的存储和表达理解核酸化学对于解析生命本质具有根本性意义本部分将从核苷酸的基本结构入手,探讨和的结构特点,以及它们在生命活动中的关键功能DNA RNA核酸研究的进展推动了分子生物学革命,从双螺旋结构的发现到基因组测序技术的发展,核酸化学始终是生命科学研究的前沿领域DNA掌握核酸化学知识,将有助于理解基因表达、蛋白质合成以及生物信息传递的分子机制核苷酸的结构与性质含氮碱基包括嘌呤、和嘧啶、、两类A GC TU五碳糖脱氧核糖或核糖DNA RNA磷酸基团提供连接骨架和负电荷核苷酸是核酸的基本构建单元,由含氮碱基、五碳糖和磷酸基团三部分组成碱基与五碳糖通过糖苷键连接形成核苷,核苷再与磷酸酯化形成核苷酸中的碱基包括腺嘌N-DNA呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶,而中被尿嘧啶替代A GC TRNA TU核苷酸除作为核酸的组成部分外,还具有多种特殊功能如是生物体主要的能量载体;ATP、作为第二信使参与信号转导;辅酶、、辅酶等参与多种代谢cAMP cGMPNAD+FAD A反应;在蛋白质合成和信号转导中发挥重要作用核苷酸衍生物还广泛应用于抗病毒GTP和抗肿瘤药物开发中的结构DNA双螺旋模型的不同构象形式Watson-Crick DNA的经典结构是右手双螺旋,存在多种构象形式,最常见DNA DNA由两条反平行的多核苷酸链通过碱的有型生物体内最普遍形B DNA基互补配对形成螺式、型脱水条件下形成,A-T,G-CA DNA旋每转一周有个碱基对,螺距杂交体常见和型10RNA-DNAZ为碱基对位于螺旋内侧,富序列区域可形成的左
3.4nm DNAGC磷酸糖骨架位于外侧碱基之间手螺旋不同构象在螺旋直径、-的氢键间两个,间三个每转碱基对数目、大沟小沟特征等A-T G-C和碱基堆积作用共同稳定双螺旋结方面存在差异,这些结构多样性与构功能调控密切相关DNA超螺旋结构DNA环状或线性固定两端时,双螺旋可形成超螺旋结构,分为正超螺旋DNA DNA右手扭转和负超螺旋左手扭转超螺旋状态影响的复制、转录等生物DNA学过程,细胞内拓扑异构酶通过调节超螺旋度维持功能状态染色体DNA与组蛋白结合形成核小体,进一步折叠压缩成高度有序的染色质结构DNA的结构与类型RNA转运RNA tRNA信使RNA mRNA负责将氨基酸运送到核糖体典型的三携带从转录的遗传信息,作为蛋白DNA叶草二级结构和形三级结构,包含反L质合成的模板结构特点包括帽子结5密码子环、氨基酸接受臂、环和D TΨC构、编码区和多聚尾巴在真核生3A环分子上的反密码子与tRNA mRNA物中,前体需经过剪接去除内含mRNA上的密码子配对,确保正确的氨基酸按子,成熟才能翻译成蛋白质mRNA序列连接核糖体RNA rRNA非编码RNA与蛋白质一起构成核糖体,提供蛋白质不编码蛋白质但具有调控功能的分RNA合成的结构骨架和催化功能真核生物4子,包括微、长链非编码、RNA RNA包含、、和四种28S18S
5.8S5S等参与基因表达调控、染色质siRNA,细菌含、和三种rRNA23S16S5S修饰、加工等多种生物学过程,是RNA具有复杂的二级结构,包含多个rRNA表观遗传学研究的重要内容茎环结构核酸的生物学功能遗传信息的储存是遗传信息的主要载体,通过特定的核苷酸序列编码生物体所有遗传特征DNA分子高度稳定的化学性质和精确的复制机制,确保了遗传信息能够稳定传递DNA给后代人类基因组包含约亿个碱基对,编码约万个蛋白质编码基因,以及302大量具有调控功能的非编码序列遗传信息的传递通过半保留复制方式实现遗传信息的代际传递;通过转录将信息传递给DNA;通过翻译将信息传递给蛋白质这构成了分子生物学中心法则的RNA RNA核心内容转录过程中,作为模板,由聚合酶催化合成;翻译DNA RNA RNA过程中,作为模板,在核糖体上合成多肽链mRNA基因表达与调控核酸在基因表达调控中发挥关键作用上的启动子、增强子、沉默子DNA等调控元件控制转录起始;剪接、编辑和降解调控加工和稳定性;RNARNA非编码如、参与转录后调控这些多层次调控机制RNA miRNAlncRNA确保基因在正确的时间、正确的细胞中以适当水平表达,是生物体发育和环境适应的基础第五部分糖类化学单糖的结构与性质糖类的基本构建单元,包括葡萄糖、果糖等多糖的结构与功能由多个单糖通过糖苷键连接形成的大分子糖类的生物学作用能量来源、结构组分和信息分子糖类是生物体内丰富的有机分子,不仅是重要的能量来源,还作为细胞结构组分和信息分子参与多种生命活动本部分将系统介绍糖类的化学结构、物理性质和生物学功能,帮助你建立对这类关键生物分子的全面认识糖类化学的研究历史悠久,从早期对单糖结构的探索到现代糖生物学的兴起,对糖类认识的深入推动了生命科学的发展随着研究技术的进步,糖类在细胞识别、免疫调节、发育过程中的重要作用逐渐被揭示,成为现代生物化学研究的热点领域之一单糖的结构与性质单糖的分类与命名单糖的立体异构单糖是最简单的糖类,不能被水解为更小的糖分子根据含有的单糖分子含有多个手性碳原子,因此存在多种立体异构体型D碳原子数量,可分为三碳糖甘油醛、四碳糖赤藓糖、五碳糖和型是根据最远离羰基的手性碳原子构型区分的生物体内主L核糖和六碳糖葡萄糖等根据含有的羰基类型,又可分为醛要存在型糖单糖的和异构体区别在于环状结构中异头碳Dαβ糖含醛基和酮糖含酮基原子上羟基的朝向单糖的命名通常包含碳原子数和羰基类型信息,如己醛糖葡萄环状结构是单糖在水溶液中的主要存在形式以葡萄糖为例,由糖、己酮糖果糖常见的生物学重要单糖包括葡萄糖、果糖、于醛基与远端羟基之间的半缩醛反应,形成六元环吡喃糖或五元半乳糖、甘露糖和核糖等环呋喃糖结构这种环化反应使异头碳产生新的手性中心,形成和两种构型,它们在水溶液中可以相互转化,达到平衡状态αβ糖苷键与多糖糖苷键的形成与特点主要二糖的结构与功多糖的分类与代表能糖苷键是连接单糖分子的多糖是由大量单糖通过糖关键化学键,由一个单糖二糖由两个单糖通过糖苷苷键连接形成的高分子化的异头碳上的羟基与另一键连接形成常见的二糖合物,按功能可分为储能个单糖的羟基通过缩合反包括麦芽糖由两个葡萄多糖和结构多糖储能多应形成根据参与形成糖糖通过糖苷键连接,糖如淀粉植物和糖原动α-1,4苷键的碳原子位置,可分作为淀粉水解的中间产物;物,由葡萄糖单元通过α-为糖苷键、蔗糖由葡萄糖和果糖通过和糖苷键连接;α-1,4β-1,41,4α-1,6糖苷键等不同类型糖苷糖苷键连接,是结构多糖如纤维素植物细α,β-1,2键的类型决定了多糖的空植物中主要的运输糖;乳胞壁和几丁质节肢动物外间结构和物理性质,如直糖由半乳糖和葡萄糖通过骨骼,提供结构支持多链淀粉中的糖苷键糖苷键连接,是哺糖的分子量和分支程度决α-1,4β-1,4使分子呈螺旋结构,而纤乳动物乳汁中的主要糖类定了其水溶性和物理特性,维素中的糖苷键则不同二糖因其结构特点具影响其在生物体内的功能β-1,4使分子呈直链状态有不同的甜度和消化特性糖蛋白与糖脂糖蛋白是蛋白质与碳水化合物结合形成的复合物,根据糖与蛋白质连接方式分为糖基化糖链与蛋白质天冬酰胺侧链的氮原子连接和N-糖基化糖链与丝氨酸或苏氨酸侧链的氧原子连接糖蛋白广泛存在于细胞膜表面和细胞外基质中,参与细胞识别、信号传导和免疫应O-答等过程血型抗原、免疫球蛋白和许多受体蛋白都是重要的糖蛋白糖脂是脂质与碳水化合物结合的复合物,主要分布在细胞膜外层,特别丰富于神经组织神经节苷脂是重要的糖脂类别,由鞘糖脂连接一个或多个糖残基组成糖脂在细胞识别、膜结构稳定和信号转导中发挥重要作用糖基化修饰对蛋白质的稳定性、溶解度和活性具有显著影响,也是许多疾病发生的重要因素,如先天性糖基化障碍疾病和某些癌症中的异常糖基化现象第六部分脂类化学脂肪酸与甘油脂复合脂质与固醇类脂类的生物学功能脂肪酸是脂类的基本构建单元,碳氢复合脂质除含脂肪酸和醇外,还含有脂类在生物体内具有多种功能作为链与羧基构成其基本结构甘油脂是其他成分,如磷脂、糖脂和脂蛋白能量储存形式和结构组分,参与信号由甘油与脂肪酸形成的酯类,包括甘固醇类是一类具有四环结构的脂溶性传导和细胞识别,同时也是重要的生油一酯、二酯和三酯,是生物体重要化合物,胆固醇是其中最重要的代表,物活性分子,如类固醇激素和前列腺的能量储存形式是细胞膜的重要组分素等脂肪酸的结构与性质脂肪酸的基本结构脂肪酸的物理化学性质脂肪酸是一类含有长链烃基和末端羧基的有机酸自脂肪酸的物理性质与其碳链长度和饱和度密切相关碳链越长,-COOH然界中的脂肪酸通常含有偶数个碳原子,形成直链结熔点越高;不饱和度越高,熔点越低这是因为不饱和脂肪酸中C4-C24构脂肪酸可根据碳链中是否含有双键分为饱和脂肪酸和不饱和的顺式双键导致碳链弯折,分子间排列不紧密,分子间力减弱脂肪酸饱和脂肪酸碳链中不含双键,如棕榈酸和硬脂酸饱和脂肪酸在室温下多为固态,主要存在于动物脂肪中;不饱和C16:0;不饱和脂肪酸碳链中含有一个或多个双键,如油酸脂肪酸在室温下多为液态,丰富于植物油和鱼油中脂肪酸可通C18:
0、亚油酸和亚麻酸不饱和脂肪酸的过其羧基参与酯化反应,与醇类形成酯类化合物,这是形成各种C18:1C18:2C18:3双键可以呈顺式或反式构型,自然界中多为顺式构型复杂脂质的基础甘油脂的结构与功能甘油二酯与甘油三酯磷脂的结构与分类甘油三酯是由一分子甘油与三分子磷脂是含磷的复合脂质,主要包括脂肪酸形成的三酯,是生物体最主甘油磷脂和鞘磷脂两大类甘油磷要的能量储存形式动物脂肪和植脂由甘油骨架、两条脂肪酸链和一物油主要由甘油三酯组成,其物理个含磷的极性头部组成,根据极性性质取决于所含脂肪酸的种类甘头部的不同分为磷脂酰胆碱、PC油二酯是细胞信号传导中的重要中磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸PE间物质,如二酰基甘油是蛋和磷脂酰肌醇等鞘磷脂DAG PSPI白激酶的激活剂,参与多种细胞信则以鞘氨醇为骨架,如神经鞘磷脂C号通路是神经组织中的重要成分膜脂质的特殊功能磷脂是生物膜的主要组成部分,其两亲性结构亲水的极性头部和疏水的脂肪酸尾部使其在水环境中自发形成双分子层结构,构成细胞膜的基本骨架不同磷脂的分布不对称性对维持膜的流动性和功能至关重要某些磷脂如及其衍生物还作为PI信号分子参与细胞信号转导,磷脂酰丝氨酸外翻是细胞凋亡的标志固醇类化合物胆固醇的合成与代谢胆固醇的结构与功能胆固醇主要在肝脏合成,经HMG-CoA胆固醇是最重要的固醇类化合物,具有还原酶途径由乙酰合成循环中的CoA特征性的四环结构,一个羟基和一个烃1胆固醇以脂蛋白复合物形式运输,LDL基侧链胆固醇是细胞膜的重要组分,2将胆固醇运送到外周组织,负责胆HDL调节膜流动性和稳定性固醇逆转运类固醇激素胆汁酸胆固醇是类固醇激素的前体物质,包括胆固醇也是胆汁酸的前体,胆汁酸作为肾上腺皮质激素如皮质醇、性激素如表面活性剂促进脂肪消化吸收胆汁酸3睾酮、雌二醇和维生素这些激素通D在肠肝循环中被重复利用,也作为信号过调节基因表达影响代谢、生殖和发育分子参与代谢调控等生理过程第七部分生物膜生物膜的流动镶嵌模型1描述膜的基本结构组织膜蛋白的类型与功能2执行膜的多种生物学功能膜转运与信号转导实现物质交换和信息传递生物膜是细胞和细胞器的边界结构,不仅起着隔离和保护作用,还是物质交换和信息传递的重要场所现代生物膜研究始于年和1972Singer提出的流动镶嵌模型,该模型描述了膜的动态流动性和蛋白质在脂质双层中的分布特点Nicolson理解生物膜的结构与功能对于解释细胞如何与环境互动至关重要本部分将详细介绍生物膜的组成、膜蛋白的多样性以及膜转运系统的工作机制,帮助你建立对这一关键细胞组分的系统认识膜结构与功能的异常与多种疾病相关,如囊性纤维化和某些神经退行性疾病生物膜的结构模型脂质双分子层生物膜的基本骨架是由磷脂双分子层构成的磷脂分子的两亲性特点亲水的极性头部和疏水的脂肪酸尾部使其在水环境中自发排列成双层结构,疏水尾部相对,亲水头部朝向水相这种排列方式形成了一个有效的渗透屏障,防止大多数水溶性物质自由通过膜流动镶嵌模型特点和于年提出的流动镶嵌模型描述了生物膜的现代观点膜蛋白如同冰山一样镶嵌在流动的脂质海洋中这一模型强调了膜的流动性和动态特性,膜Singer Nicolson1972中的脂质和蛋白质可以在膜平面内自由扩散,但很少从一侧翻转到另一侧翻转运动膜的动态特性现代研究表明,膜不仅仅是均一的流体,而是存在脂筏等微区结构,这些区域富含胆固醇和鞘脂,形成相对有序的膜岛膜的流动性受多种因素影响,包括温度、脂肪酸组成和胆固醇含量不饱和脂肪酸增加膜流动性,而胆固醇则在高温时减少流动性,在低温时防止膜过度凝固,起到调节作用膜蛋白的类型与功能膜蛋白的分类膜蛋白的功能根据与膜的结合方式,膜蛋白可分为两大类整合膜蛋白和周边膜蛋白执行多种关键的生物学功能膜蛋白整合膜蛋白跨膜蛋白至少有一部分穿过脂质双层,通转运功能包括被动转运的通道蛋白和载体蛋白,以及主动•常含有富含疏水性氨基酸的跨膜区域,牢固地嵌入膜中根据跨转运的泵如葡萄糖转运蛋白、⁺⁺等Na/K-ATPase膜区域的数量和排列方式,可进一步分为单次跨膜蛋白和多次跨酶催化功能许多膜蛋白具有酶活性,催化膜两侧的生化反膜蛋白•应如细胞色素氧化酶、合酶等ATP周边膜蛋白不穿透脂质双层,而是通过与膜表面的整合膜蛋白或受体功能膜受体识别特定信号分子并将信息传递到细胞内•膜脂质极性头部的相互作用而与膜结合这些相互作用主要是非部如蛋白偶联受体、酪氨酸激酶受体等G共价的,如静电作用、氢键等,因此周边膜蛋白相对容易从膜上细胞识别参与细胞细胞或细胞基质识别和粘附如整合•--解离某些蛋白质通过脂质修饰如脂酰化、异戊二烯化与膜锚素、钙粘蛋白等定,也属于膜蛋白的一种结构支持与细胞骨架连接,维持细胞形态如带蛋白、锚•蛋白等膜转运系统第八部分生物氧化与能量代谢生物氧化的概念电子传递链1生物体内的氧化还原过程,是能量获取线粒体内膜上的电子传递系统,将还原的主要方式当量传递给氧的利用氧化磷酸化ATP3高能磷酸键能量驱动生命活动偶联电子传递能量与合成的过程ATP生物氧化的概念与特点生物氧化的定义生物氧化的方式生物氧化是指生物体内有机物质如糖、生物氧化主要包括两种类型一是脱脂肪酸和氨基酸逐步被氧化分解,释氢氧化,通过脱氢酶催化底物失去氢放能量并最终产生₂和₂的过原子即电子和质子,是最常见的生CO H O程从化学本质上看,生物氧化是一物氧化方式;二是氧化酶催化的直接系列氧化还原反应,涉及电子或氢原氧化,氧分子直接参与反应,常见于子的转移底物失去电子被氧化,而某些特殊代谢途径在有氧条件下,氧化剂得到电子被还原电子最终传递给氧分子,形成水;无氧条件下,可能传递给其他电子受体与非生物氧化的区别生物氧化与非生物氧化如燃烧的主要区别在于生物氧化是多步骤、温和条件下进行的可控过程,能量以小包裹形式逐步释放并高效储存;而燃烧是一步完成的剧烈反应,能量以热能形式迅速释放,利用效率低生物氧化的精确调控是生物体能量代谢高效性的关键高能化合物1的结构与性质ATP三磷酸腺苷是由腺嘌呤、核糖和三个磷酸基团组成的核苷三磷酸的关ATP ATP键特性是其含有两个高能磷酸键,水解这些键释放大量能量~P ATP→ADP+Pi释放约能量;释放约能量的
30.5kJ/mol ATP→AMP+PPi
45.6kJ/mol ATP高能本质源于磷酸基团间的静电排斥、共振稳定性减少以及水解产物的稳定性增加其他高能磷酸化合物除外,生物体内还存在多种高能磷酸化合物,包括磷酸肌酸,在肌肉组ATP CP织中作为的储备;磷酸烯醇式丙酮酸,糖酵解中的高能中间体;二ATP PEP1,3-磷酸甘油酸,含有高能酰基磷酸键;核苷二磷酸和三磷酸如,参与特定生化GTP反应;焦磷酸和多磷酸盐,某些代谢反应中的能量中间体PPi高能键的生物学意义高能磷酸键是生物体能量货币的核心,通过水解释放的能量驱动各种生命活动ATP驱动生物合成反应,如蛋白质、核酸和多糖的合成;实现主动运输,维持离12子梯度;支持机械功,如肌肉收缩和鞭毛运动;驱动细胞信号传导;维持345体温的合成与水解形成能量循环,是生物体能量流动的中心环节ATP线粒体电子传递链复合物I脱氢酶复合物,接受来自的电子,泵出个⁺NADH NADH4H复合物II琥珀酸脱氢酶,接受来自₂的电子,不泵出⁺FADH H复合物III细胞色素₁复合物,泵出个⁺bc4H复合物IV细胞色素氧化酶,将电子传给₂形成₂,泵出个⁺c OHO2H线粒体电子传递链呼吸链是有氧呼吸的核心部分,位于线粒体内膜上,由四个主要蛋白质复合物和两个可移动电子载体辅酶和细胞色素组成电子传递链将三羧酸循环和脂肪酸氧化产生的还原当量Q c和₂中的高能电子传递给最终电子受体氧分子,同时将释放的能量用于跨膜泵出质子NADH FADH电子在呼吸链中的传递遵循电势差递减原则,从低电势传向高电势常见的电子传递抑制剂包括鱼藤酮抑制复合物、杀线威抑制复合物、抗霉素抑制复合物和氰化物抑制复合物这些抑制剂不III AIIIIV仅是研究呼吸链的重要工具,也是一些重要毒物的作用机制氧化磷酸化化学渗透学说合成酶的结构与功能比与能量效率ATP P/O化学渗透学说是由于合成酶是一个跨膜蛋比是指每传递一对电子到氧分子时合Peter MitchellATP ComplexV P/O年提出的解释氧化磷酸化机制的理白复合物,由两个主要部分组成₀和成的分子数对氧化,理论1961F ATPNADH论,获得年诺贝尔化学奖该学说₁₀部分嵌入线粒体内膜,形成质子比约为每对电子泵出个⁺,1978F FP/O
2.510H指出,电子传递过程中释放的能量用于将通道;₁部分伸向基质侧,具有催化每合成个需要约个⁺通过F1ATP4H ATP质子从线粒体基质泵入膜间隔,形成跨膜合成的活性位点当质子沿浓度梯度合酶;对₂氧化,比约为ATPFADH P/O质子梯度包括梯度和电位梯度,这一通过₀部分时,驱动₀的亚基环旋转,每对电子泵出个⁺葡萄糖完全pHF Fc
1.56H质子动力势随后驱动合酶合成这一旋转通过中心轴亚基传递给₁部氧化的净能量效率约为,剩余能量以ATP ATPγF40%质子动力势相当于储存在电池中的能量,分,导致₁构象变化,促进与结热形式释放与直接燃烧葡萄糖相比,生F ADPPi而合酶则相当于利用这一能量的装置合并合成这一机械偶联过程被称为物氧化通过多步骤释放能量,使能量转化ATP ATP旋转催化机制效率大大提高第九部分代谢与调控糖代谢脂类代谢包括糖酵解、糖异生、三羧酸循环等,脂肪酸氧化提供大量能量,而脂肪酸β-是细胞能量获取的主要途径糖代谢调合成是能量储存途径脂质代谢受多种12控中,葡萄糖通过胰岛素和胰高血糖素酶和激素调控,如脂肪酶、脂肪酸合成等激素精密控制,确保血糖稳定酶以及胰岛素和肾上腺素等代谢整合与调控蛋白质与氨基酸代谢多层次调控机制确保代谢途径协调运行,蛋白质周转、氨基酸的转化和氨的处理包括底物浓度调控、酶活性调控、基因是主要过程氨基酸碳骨架可转化为糖3表达调控和激素调控这种精密调控使或脂肪酸,而氨基基团通过尿素循环排细胞能够适应不同生理状态和环境变化出体外,避免毒性积累糖酵解途径1预备阶段第步1-5这一阶段消耗个,将葡萄糖活化并裂解为两个三碳化合2ATP物首先,己糖激酶催化葡萄糖磷酸化形成葡萄糖磷酸;-6-随后经磷酸葡萄糖异构酶转化为果糖磷酸;再经磷酸果糖-6-激酶进一步磷酸化为果糖二磷酸;最后通过醛缩酶裂解-1,6-为甘油醛磷酸和二羟丙酮磷酸,后者在三磷酸异构酶作用-3-下转化为甘油醛磷酸-3-2能量收获阶段第步6-10这一阶段产生个和个,实现能量净收益甘油4ATP2NADH醛磷酸脱氢酶催化甘油醛磷酸氧化并产生,形-3--3-NADH成二磷酸甘油酸;磷酸甘油酸激酶催化高能磷酸基团转移1,3-至形成;磷酸甘油酸变位酶、烯醇酶和丙酮酸激酶催ADP ATP化后续步骤,最终形成丙酮酸并再次产生每个葡萄糖经ATP过完整糖酵解,净产生个、个和个丙酮酸2ATP2NADH2三羧酸循环83循环反应步数产量NADH循环完成一圈需要个连续反应步骤,每步由特定酶催化每循环产生个分子,每个经氧化磷酸化可产生约个TCA83NADH NADH
2.5ATP11₂产量产量FADH GTP每循环产生个₂分子,经氧化磷酸化可产生约个每循环直接产生个分子,能量等同于个1FADH
1.5ATP1GTP1ATP三羧酸循环循环又称柠檬酸循环或克雷布斯循环,是有氧代谢的核心途径,在线粒体基质中进行循环始于乙酰来自丙酮酸的氧化脱羧或脂肪酸氧化与草酰乙酸结合形成柠檬酸随后经过TCACoA一系列氧化脱羧反应,最终再生草酰乙酸,完成一个循环循环与其他代谢途径有广泛联系接收糖酵解、脂肪酸氧化和氨基酸代谢的底物;提供生物合成所需的中间体,如酮戊二酸谷氨酸合成、草酰乙酸天冬氨酸合成和琥珀酰卟啉合成;TCAβ-α-CoA为电子传递链提供还原当量和₂循环的关键调节酶包括柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶和酮戊二酸脱氢酶NADH FADHα-糖异生作用糖异生的生理意义糖异生与糖酵解的区别糖异生是指从非糖前体如乳酸、丙氨酸、甘油和某些氨基酸合糖异生不是糖酵解的简单逆转,而是有特定的旁路反应糖酵解成葡萄糖的代谢途径,主要发生在肝脏和肾脏糖异生的主要生中的三个不可逆步骤己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶催理意义是在禁食或剧烈运动等情况下维持血糖稳定,保证大脑和化的反应在糖异生中被其他酶催化的反应替代红细胞等必须使用葡萄糖的组织有充足能量供应丙酮酸羧化酶和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶将丙酮酸转化为磷酸•在禁食早期,肝糖原分解是维持血糖的主要方式;禁食超过烯醇丙酮酸24小时后,肝糖原逐渐耗尽,糖异生成为维持血糖的主要途径运果糖二磷酸酶催化果糖二磷酸水解为果糖•-1,6--1,6--6-动过程中,肌肉产生的乳酸可通过循环转运至肝脏进行糖异Cori磷酸生,为持续运动提供能量支持葡萄糖磷酸酶肝脏和肾脏特有催化葡萄糖磷酸水•-6--6-解为葡萄糖糖异生需要消耗能量,合成分子葡萄糖需要个和个16ATP2,远大于糖酵解中产生的能量,这反映了合成过程通常比GTP分解过程需要更多能量的生物热力学原理脂肪酸的氧化氧化的活化与转运β-脂肪酸氧化始于细胞质中的活化过程,脂肪酸在酰基合成酶作用下与结合形成脂酰CoA CoA,消耗个活化的脂酰通过肉碱穿梭系统转运到线粒体基质,准备进行氧化CoA1ATP CoA这一转运过程对长链脂肪酸尤为重要,短链和中链脂肪酸可直接进入线粒体氧化循环过程β-氧化是一个循环过程,每次循环脂肪酸碳链缩短个碳原子,同时产生个乙酰、β-21CoA个和个₂每个循环包含四步反应脱氢产生₂、加水、再脱1NADH1FADHFADH氢产生和硫解产生乙酰和缩短的脂酰这一循环持续进行,直到整NADHCoA CoA个脂肪酸分解完毕奇数碳脂肪酸最终会产生丙酰,需通过特殊途径进入循环CoA TCA能量产出分析脂肪酸氧化产生的乙酰进入循环进一步氧化,和₂通过电子CoA TCANADH FADH传递链产生以棕榈酸为例,完全氧化可产生个₂每个产ATP C16:07FADH生个、个每个产生个和个乙酰每个通过循环
1.5ATP7NADH
2.5ATP8CoA TCA产生个,总计约个考虑到活化消耗个,净产出约个10ATP129ATP2ATP127,远高于葡萄糖氧化的约个,这解释了为什么脂肪是如此高效的能ATP30-32ATP量储存形式氨基酸代谢氨基酸代谢的第一步是脱氨基作用,主要通过两种方式进行转氨基作用和氧化脱氨基作用转氨基作用由转氨酶催化,将氨基从氨基酸转移到酮戊二酸上,形成谷氨酸和相应的酮酸;氧化脱氨基作用由谷氨酸脱氢酶催化,将谷氨酸转化为酮戊二酸,同时释放出氨α-α-α-氨对神经系统有毒性,必须及时清除哺乳动物通过尿素循环将氨转化为低毒性的尿素排出体外尿素循环主要在肝脏进行,包括五个酶促步骤碳酰磷酸合成酶、鸟氨酸转氨甲酰酶、精氨酰琥珀酸合成酶、精氨酰琥珀酸裂解酶和精氨酸酶尿素循环缺陷可导致高氨血症和相关神经I系统障碍氨基酸碳骨架的代谢去向多样,可转化为葡萄糖糖原性氨基酸、酮体酮原性氨基酸或直接进入循环氨基酸代谢紊乱与多种TCA遗传代谢病相关,如苯丙酮尿症和枫糖尿症代谢调控基因表达水平调控控制代谢酶的合成与降解酶活性调节2通过变构效应和共价修饰快速调节酶活性底物水平调控底物和辅因子浓度影响代谢流速代谢途径的相互联系形成复杂的代谢网络,需要精密调控以维持细胞稳态关键代谢交叉点通常是调控的焦点,如丙酮酸连接糖酵解和循环、TCA乙酰连接糖、脂和氨基酸代谢和草酰乙酸连接糖异生和循环代谢途径通常遵循需要原则和经济原则,即只在需要时激活,并尽量CoATCA减少能量浪费激素在代谢调控中发挥重要作用胰岛素促进葡萄糖利用和储存,抑制分解代谢;胰高血糖素促进糖异生和糖原分解,提高血糖;肾上腺素和去甲肾上腺素在应激状态下动员能量储备;皮质醇促进蛋白质分解和糖异生协同调控确保各代谢途径协调运行,如促进合成代谢时通常抑制相应的分解代谢,反之亦然这种精密调控使细胞能够适应不同生理状态和环境变化第十部分维生素与辅酶脂溶性维生素水溶性维生素脂溶性维生素包括维生素、、和,具有疏水性特点,可在水溶性维生素包括族维生素₁、₂、₃、₅、₆、A DE K B B B B BB体内储存,主要通过脂肪吸收维生素视黄醇对视觉、生长₇、₉、₁₂和维生素,易溶于水,体内不易储存,多ABBBC和免疫功能至关重要;维生素胆钙化醇促进钙吸收和骨骼健余的通常从尿液排出这类维生素主要作为辅酶参与代谢反应D康;维生素生育酚作为抗氧化剂保护细胞膜;维生素对血硫胺素₁参与碳水化合物代谢;核黄素₂和烟酰胺₃EKBBB液凝固必不可少这类维生素过量摄入可能导致毒性反应是电子传递的辅酶;泛酸₅是辅酶的组成部分;吡哆醇BA₆参与氨基酸代谢;叶酸₉和钴胺素₁₂参与合BBBDNA成;维生素是重要的抗氧化剂C维生素与辅酶的关系辅酶NAD+/NADP+FAD/FMN A由烟酰胺维生素₃衍生而来,是重要的氧由核黄素维生素₂衍生而来,是另一类重由泛酸维生素₅、和巯基乙胺合成,BBBATP化还原辅酶主要参与分解代谢中的氧要的氧化还原辅酶在循环、脂肪是酰基转移的关键辅酶辅酶在碳水化合物、NAD+FAD TCAA化反应,如糖酵解、循环和氧化;酸氧化和氨基酸代谢中发挥作用,常与脱氢酶脂肪和蛋白质代谢中起中心作用,通过形成硫TCAβ-主要参与合成代谢,如脂肪酸和类固结合形成黄素蛋白是核黄素的另一种酯键活化酰基,促进转移反应乙酰是NADP+FMN CoA醇合成比率对细胞氧化还原活性形式,如在电子传递链的复合物中核关键代谢中间体,连接糖酵解、脂肪酸代谢和NAD+/NADH I状态至关重要,影响多种代谢过程烟酰胺缺黄素缺乏可导致口角炎、舌炎和皮炎,严重时循环泛酸广泛存在于食物中,缺乏症TCA乏可导致糙皮病,表现为皮炎、腹泻和痴呆影响生长发育罕见,但可能导致疲劳和神经肌肉功能障碍总结与展望课程知识体系回顾本课程系统介绍了生物化学的基础理论和核心概念,从生物大分子蛋白质、核酸、糖类和脂类的结构与功能,到酶学、生物膜、生物氧化与能量代谢,再到代谢途径与调控网络这些知识构成了理解生命科学的分子基础,也是后续专业课程学习的重要支撑通过本课程,您应掌握生物化学的基本原理,理解生命活动的化学本质生物化学前沿研究方向生物化学研究正朝着多个前沿方向发展系统生物学整合多组学数据,构建全面代谢网络模型;合成生物学设计新的代谢途径和生物系统;单细胞技术揭示细胞间代谢异质性;代谢组学全面分析细胞代谢物;生物信息学和人工智能加速蛋白质结构预测和药物设计;精准医学将生物化学知识应用于个体化疾病诊断和治疗;生物能源研究开发可持续能源解决方案学习方法与考试要点有效学习生物化学的建议建立知识框架,理解而非死记硬背;关注分子结构与功能的关系;掌握关键代谢途径的调控点;多做习题,加深理解;结合实验观察,提高实践能力考试重点通常包括生物大分子结构特点;酶动力学和调节机制;主要代谢途径的关键步骤和能量计算;代谢途径的整合与调控;生物膜结构与功能;基础知识在疾病机制中的应用保持良好学习习惯,定期复习,并通过小组讨论加深理解。
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