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典型生物学机制欢迎参加《典型生物学机制》课程本课程将深入探讨生命科学的核心机制,从分子水平到系统层面,全面解析生物体如何维持生命活动我们将系统地介绍细胞结构、代谢过程、信号转导、免疫调控等关键生物学机制,并结合前沿研究进展,帮助您构建完整的生物学机制知识体系本课程旨在培养学生的系统思维和科学研究能力,使您能够理解复杂生物系统背后的运行规律通过本课程的学习,您将能够将分散的生物学知识点连接成有机整体,为进一步的专业学习和科研工作打下坚实基础课程导入生物学机制定义生物学机制是指生物体内维持生命活动的分子、细胞和系统层面的结构和功能关系网络它解释了为什么和如何这些生物过程得以实现,是理解生命科学的核心基础研究意义深入理解生物学机制有助于我们揭示生命本质,为疾病治疗、生物技术开发和生态保护提供理论基础机制研究是连接基础生物学与应用领域的桥梁课程构成本课程包括分子基础、细胞结构、代谢机制、遗传信息传递、信号转导、免疫调控等模块,并结合典型案例和前沿进展进行讲解学习目标通过本课程学习,您将掌握关键生物学机制的基本原理,培养系统思维能力,并能够将这些知识应用于解决实际生物学问题中生命的分子基础核酸作为遗传信息的载体,和在信息存储、传递和表达中发挥关键作用采用双螺旋结构,可通过互补配对进行自我复制;种类多样,包括DNA RNA DNA RNA信使、转运和核糖体等,参与蛋白质合成过程RNA RNA RNA蛋白质作为生命活动的执行者,蛋白质具有催化、运输、调节、防御等多种功能由氨基酸按特定顺序连接形成,其空间结构决定了其功能酶是蛋白质的重要类别,能显著提高生化反应速率糖类与脂质糖类是主要能量来源,如葡萄糖;也是细胞表面识别和结构组分脂质构成生物膜的基本骨架,参与信号传导,还作为能量储存形式磷脂双分子层的疏水性是细胞区隔化的物质基础细胞基本结构及分工线粒体细胞的能量工厂,具有双层膜结构内膜细胞核形成嵴增加表面积,是电子传递链和合ATP成酶所在位置进行有氧呼吸,产生大量细胞的指挥中心,含有遗传物质核膜DNA上有核孔复合体控制物质出入核仁负责核ATP糖体的合成和核糖体装配RNA内质网与高尔基体粗面内质网合成分泌蛋白,光面内质网合成脂质高尔基体修饰、分选和包装蛋白质,共同构成蛋白质合成和运输系统叶绿体植物特有细胞器,进行光合作用类囊体膜溶酶体与过氧化物酶体上含有光合系统和电子传递链,基质中进行溶酶体含多种水解酶,负责胞内消化;过氧碳固定反应化物酶体含氧化酶和过氧化氢酶,参与脂肪酸氧化和过氧化氢分解细胞周期调控基本原理期G1期S细胞从分裂后进入的第一个间期阶段合成期,细胞复制全部在DNA DNA细胞在此阶段进行正常生长,合成RNA这一阶段,染色体的含量从二倍体DNA和蛋白质,准备复制此期有限制DNA增加到四倍体组蛋白合成和2n4n点,决定细胞是进入期还是进入期S G0染色体复制同步进行休眠状态期期M G2有丝分裂期,包括前期、中期、后期和复制后的间隙期,细胞继续生长并DNA末期染色体浓缩、排列、分离,最终合成与有丝分裂相关的蛋白质细胞检形成两个完全相同的子细胞此期细胞查是否正确复制,为有丝分裂做最DNA不再合成大分子后准备细胞周期调控机制详解周期蛋白依赖性激酶活性调控机制关键检查点CDK CDK是丝氨酸苏氨酸蛋白激酶,需要与活性受多层次调控与周期蛋白细胞周期中存在多个检查点检查CDK/CDK1G1/S周期蛋白结合才能激活不同周期结合;激活性磷酸化环磷酸化;点限制点,确保完整性;CDK-2T3DNA G2/M蛋白复合物调控细胞周期不同阶段的进抑制性磷酸化;检查点,检查复制完整性;纺锤体Tyr15/Thr14DNA程例如,调控抑制蛋白如、的检查点,确保染色体正确连接到纺锤体CDK4/6-CyclinD G14CDK CKIp21p27期,促进转换,结合这些机制确保细胞周期的精确调这些检查点在发现问题时可激活等CDK2-CyclinE G1/S p53控制期,控蛋白,导致细胞周期阻滞或凋亡CDK2-CyclinA SCDK1-调控期CyclinB M细胞凋亡机制外源性通路由细胞表面的死亡受体激活,如受体、受体配体结合后,受体聚集并招募适TNF Fas配蛋白,形成死亡诱导信号复合物,激活起始,继而激活执行DISC Caspase-8/10Caspase内源性通路由线粒体介导,响应损伤、氧化应激等胞内信号家族蛋白如、DNA Bcl-2Bax Bak促进线粒体外膜通透性增加,释放细胞色素,与和前形成凋亡体,c Apaf-1Caspase-9激活Caspase-9执行阶段两条通路汇聚激活执行、、,这些蛋白酶切割多种细胞底物,如核骨Caspase367架和修复蛋白细胞表现为染色质浓缩、断裂、细胞皱缩和凋亡小体形成DNA DNA吞噬清除凋亡细胞表面呈现吃我信号如磷脂酰丝氨酸外翻,被吞噬细胞识别并吞噬,避免细胞内容物释放引起炎症这使凋亡成为一种干净的细胞死亡方式物质代谢概述三大营养物质代谢糖、脂、蛋白质代谢构成生物体代谢网络的核心代谢关联各代谢途径间存在多层次交叉连接能量与物质平衡分解代谢提供能量,合成代谢消耗能量多级调控受底物产物浓度、激素和神经系统精密调控/生物体内的代谢网络极其复杂而精密,通过多种中间产物实现不同代谢途径的连接例如,糖代谢产生的丙酮酸可转化为乙酰,进入循环或脂肪酸合CoA TCA成;氨基酸分解后的碳骨架可进入糖异生或循环;磷酸戊糖途径产生的则为脂肪酸合成提供还原力TCA NADPH值得注意的是,不同组织的代谢特点存在显著差异,如肝脏是主要代谢器官,大脑主要利用葡萄糖,肌肉依赖糖原供能,脂肪组织负责甘油三酯储存这些代谢差异形成了组织间的代谢分工,共同维持机体整体稳态糖的有氧氧化机制糖酵解将葡萄糖分解为丙酮酸,产生少量和ATP NADH丙酮酸脱氢丙酮酸转化为乙酰,释放₂并产生CoA CONADH循环TCA乙酰完全氧化,产生₂、、₂和CoA CONADH FADHGTP氧化磷酸化和₂通过电子传递链生成大量NADH FADH ATP葡萄糖完全氧化是一个多步骤、高效率的能量转换过程首先在细胞质中,葡萄糖经过步酶促反应转化为丙酮酸,产生个和个关键酶包括己糖激102ATP2NADH酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶,它们催化不可逆反应,是调控点丙酮酸进入线粒体后,由丙酮酸脱氢酶复合体转化为乙酰随后乙酰进入循环,经过步反应完全氧化,产生个、个₂和个CoA CoA TCA86NADH2FADH2GTP最后,这些还原性辅酶在电子传递链中被氧化,释放的能量用于合成一分子葡萄糖完全氧化理论上可产生个ATP30-32ATP糖酵解和有氧氧化比较糖酵解有氧氧化调控差异糖酵解是葡萄糖分解的第一阶段,发生有氧氧化包括丙酮酸氧化、循环和两种途径受不同信号调控高TCA在细胞质中,不需要氧气参与一分子氧化磷酸化,主要发生在线粒体中,需比值促进糖酵解,而高AMP/ATP葡萄糖分解为两分子丙酮酸,净产生两要氧气作为最终电子受体葡萄糖完全⁺比值抑制循环葡NADH/NAD TCA分子和两分子关键调控酶氧化可产生约个,效率远高萄糖充足时,柠檬酸和可抑制磷酸ATP NADH30-32ATP ATP包括己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸于糖酵解果糖激酶活性,降低糖酵解速率细胞激酶根据氧气供应和能量需求动态调整这两能量产率高,每摩尔葡萄糖可产生•条途径的活性能量产率低,每摩尔葡萄糖仅产生摩尔剧烈运动时,肌肉依赖糖酵解供能•230-32ATP•摩尔ATP反应较慢,需要更多酶促步骤休息状态下,细胞主要通过有氧氧化••反应速率快,可在短时间内提供能量产生能量•严格依赖氧气,无氧条件下无法进行•肿瘤细胞偏好糖酵解效应•Warburg不需要氧气,可在缺氧环境中进行•磷酸戊糖途径氧化阶段非氧化阶段葡萄糖磷酸经过氧化转变为核糖核糖磷酸经过一系列碳原子重排反应,-6--5--5-磷酸,同时生成分子这一阶段最终生成果糖磷酸和甘油醛磷酸,2NADPH-6--3-由葡萄糖磷酸脱氢酶催化第一步反应,这些中间产物可重新进入糖酵解这一阶-6-该酶是速率限制酶,受⁺段建立了与糖酵解之间的联系NADPH/NADP PPP比值调控核糖磷酸木酮糖磷酸果•-5-→-5-→葡萄糖磷酸磷酸葡萄糖酸糖磷酸•-6-→6-→-6-核糖磷酸-5-不产生,主要为再生葡萄糖•NADPH-产生用于生物合成还原反应磷酸•2NADPH6-生理意义是细胞中和核糖的主要来源,对于维持氧化还原平衡和核酸合成至关重要不PPP NADPH同组织中活性存在差异,反映其特定代谢需求PPP供应支持脂肪酸合成和抗氧化防御•NADPH核糖磷酸和合成的前体•-5-DNA RNA红细胞中活跃,维持谷胱甘肽还原•三羧酸循环机制TCA脱羧阶段乙酰进入CoA柠檬酸经异柠檬酸转变为酮戊二酸,α-乙酰与草酰乙酸结合形成柠檬酸,CoA后者脱羧形成琥珀酰这两步脱羧CoA这一不可逆反应由柠檬酸合成酶催化反应各释放一分子₂,同时产生CO乙酰来源多样,包括糖酵解、脂肪CoA酮戊二酸脱氢酶复合体是关NADHα-酸氧化和某些氨基酸分解β-键调控点循环完成能量保存阶段草酰乙酸再生,准备接受新的乙酰CoA琥珀酰转变为草酰乙酸过程中,生CoA分子每转一圈循环,产生个TCA3成个相当于、个₂1GTP ATP1FADH、个₂、个和个NADH1FADH1GTP2和个琥珀酸脱氢酶将琥珀酸1NADH₂循环中间产物还可参与氨基酸合CO氧化为延胡索酸,同时还原为FAD成等反应₂FADH电子传递链与能量代谢复合物I泛醌氧化还原酶它接收的电子,将其传递给NADH-NADH泛醌,同时将个⁺泵出线粒体内膜这是一个巨大的CoQ4H形蛋白复合物,含有多个铁硫中心L复合物II琥珀酸泛醌氧化还原酶它氧化循环中的琥珀酸为延胡-TCA索酸,同时将电子传递给泛醌与复合物不同,它不泵出质子,I复合物III因此能量效率较低泛醌细胞色素氧化还原酶它接收还原型泛醌的电子,通过-c循环机制将电子传递给细胞色素,同时将质子泵出内膜Q c4复合物IV细胞色素氧化酶它是电子传递链的最后一站,将电子传递c给最终受体₂,将其还原为₂该过程也伴随质子泵出,O HO合成酶ATP对维持质子梯度至关重要₀₁合成酶利用质子沿浓度梯度流回基质的能量合F F-ATP成每个质子流动可合成个这一过程体现了ATP3-41ATP化学渗透偶联理论的生成与能量转移ATP30-32葡萄糖氧化ATP产量一分子葡萄糖完全氧化可产生的理论数量,包括底物水平磷酸化和氧化磷酸化ATP
2.5NADH的P/O比每对从转移到氧的电子可合成的数量,反映经复合物途径的能量转化效率NADH ATPNADH I
1.5FADH₂的P/O比每对从₂转移到氧的电子可合成的数量,比低是因为电子从复合物进入,跳过了一个质子泵FADHATPNADH II
7.3ATP水解ΔG kcal/mol水解为和时释放的自由能,使成为理想的能量载体分子ATP ADPPi ATP是细胞内主要的能量货币,其高能磷酸键水解释放的能量驱动各种生物化学反应除了,细胞内还存在其他高能磷酸化合物,如磷酸肌酸、ATP ATPPCr二磷酸甘油酸和磷酸烯醇式丙酮酸特别是磷酸肌酸在肌肉组织中作为的储备形式,可通过肌酸激酶反应迅速再生1,3-PEP ATPATP细胞通过精确控制比例来维持能量平衡当水平下降时,激活蛋白激酶被激活,促进产能代谢并抑制耗能过程这种调控确保ATP/ADP ATPAMP AMPK了细胞能量供需平衡,维持正常生理功能氧化磷酸化效率可受多种因素影响,如质子泄漏和解偶联蛋白的表达水平蛋白质合成与降解机制转录与加工RNA作为模板,由聚合酶合成前体在真核细胞中,前体需经过剪接去除内含子、加帽和加多聚尾等加工过程,形成成熟后DNA RNA mRNA mRNAA mRNA运出细胞核翻译起始小核糖体亚基识别上的起始密码子,起始携带甲硫氨酸结合,大亚基加入形成完整核糖体这一过程需要多种起始因子参与,消mRNA AUGtRNAeIF耗能量GTP肽链延长核糖体沿移动,根据密码子序列将相应氨基酰添加到生长的肽链上每次肽键形成需要个水解提供能量延长因子协助定位mRNA-tRNA2GTP EFtRNA和核糖体移位翻译终止当核糖体遇到终止密码子、、时,释放因子结合并促使合成的多肽释放核糖体亚基解离,可再次参与新一轮翻译UAA UAGUGA蛋白质降解蛋白质寿命有限,通过泛素蛋白酶体系统或溶酶体系统降解在泛素系统中,靶蛋白先被多个泛素标记,然后被蛋白酶体识别并降解为短肽-26S氨的代谢和转氨基作用转氨基作用转氨基作用是氨基酸代谢的第一步,将氨基从氨基酸转移到酮酸上,形成新的氨基酸和酮酸这一反应由转氨酶又称氨基转移酶催化,如谷氨酸草α-α--酰乙酸转氨酶和谷氨酸丙酮酸转氨酶反应需要维生素衍生物吡哆磷酸作为辅酶GOT-GPT B6PLP氨的生成与解毒氨主要来源于氨基酸中氨基的脱除和肠道细菌分解蛋白质由于氨对神经系统有毒性,必须迅速转化为无毒形式在肝脏中,通过尿素循环将氨转化为尿α-素;在肾脏中,通过谷氨酰胺合成酶将氨与谷氨酸结合形成谷氨酰胺;在脑组织中,谷氨酸脱氢酶催化氨与酮戊二酸形成谷氨酸α-尿素循环尿素循环是肝脏中解毒氨的主要途径,包括个酶促反应碳酰磷酸合成酶、鸟氨酸转氨甲酰酶、精氨基琥珀酸合成酶、精氨基琥珀酸裂解酶和精氨酸酶5I该循环连接细胞质和线粒体,一个循环消耗个,产生一分子尿素,尿素通过血液运输到肾脏排出体外3ATP脂质代谢及调控脂肪酸氧化脂肪酸合成代谢调控β-氧化是脂肪酸分解的主要途径,主要脂肪酸合成在细胞质中进行,由脂肪酸脂质代谢受多层次调控短期调控主要β-发生在线粒体基质中长链脂肪酸先通合成酶复合物催化与氧化不同,它通过酶活性修饰,如乙酰羧化酶β-CoA过肉碱穿梭系统进入线粒体,然后经历采用顺序加成方式延长碳链合成起始的磷酸化;长期调控则涉及转录ACC四步循环反应脱氢水合脱于乙酰羧化为丙二酰,随后经因子如促进脂肪酸合成和FAD→→CoA CoASREBP-1c氢⁺硫解裂,每次循环释放一历四步循环缩合还原脱水还原,促进氧化胰岛素促进脂肪NAD→→→→PPARαβ-个乙酰分子每次氧化一个碳碳键每次循环碳链延长两个碳原子过程需合成,而胰高血糖素和肾上腺素促进脂CoA产生个当量要供应还原力,来源于磷酸戊糖肪分解能量状态也是关键调节因素,5ATP NADPH₂、途径和苹果酸酶如在能量不足时抑制脂肪合成并1FADH
1.5ATP AMPK和乙酰激活氧化1NADH
2.5ATP1β-CoA10ATP遗传信息的传递概述——复制DNA遗传信息的精确复制是细胞分裂的前提聚合酶沿着解旋的双链模板合成互DNA DNA补链,形成两条完全相同的子代分子这一过程遵循半保留复制原则,每条子代DNA由一条亲代链和一条新合成链组成DNA转录上的遗传信息被转录为,由聚合酶催化转录起始于启动子,终止于DNA RNA RNA终止子,仅使用的一条链作为模板真核生物中,初级转录产物需经过加帽、剪DNA接和加多聚尾等加工才能形成成熟AmRNA翻译携带的遗传信息在核糖体上被翻译成蛋白质通过其反密码子识别mRNA tRNA上的密码子,将特定氨基酸带到核糖体上核糖体将氨基酸连接成肽链,最终mRNA形成具有特定氨基酸序列的蛋白质后转译修饰新合成的蛋白质常需要进一步修饰才能获得完全功能这些修饰包括糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化等,可以调节蛋白质的活性、定位和寿命,增加了蛋白质组的多样性的空间结构与功能DNA双螺旋基本特征多态性DNA通常呈型右手双螺旋结构,由在不同环境条件下可呈现不同构DNA B DNA两条反向平行的多核苷酸链通过氢键象型是生理条件下的主要形BDNA连接而成每个螺旋周期约个碱式,含水量高,碱基对几乎垂直于螺10基对,长纳米碱基对位于螺旋旋轴型在相对脱水环境中形
3.4ADNA内部,形成疏水性核心;带负电的糖成,螺旋更紧密,碱基对倾斜型Z磷酸骨架位于外部,与水分子和离是左手螺旋,在高盐浓度或特定-DNA子相互作用碱基配对遵循沃森克碱基序列如交替序列中出现,在-GC里克规则配对两个氢键,配基因调控中可能有特殊功能这些构ATG对三个氢键象转变与特定蛋白质的识别和结合密C切相关超螺旋与包装DNA在细胞中,以高度压缩状态存在原核生物形成超螺旋结构;真核生物DNA DNA先缠绕组蛋白形成核小体,核小体进一步折叠形成染色质纤维染色质的压缩程DNA度影响基因的可及性,从而调控基因表达在分裂期,染色质进一步浓缩成可见的染色体拓扑异构酶可改变超螺旋状态,对复制和转录至关重要DNA DNA复制的分子机制DNA复制起始复制从特定的起始位点开始在原核生物中,蛋白结合起始DNA oriDnaA位点并促使双链局部解旋;在真核生物中,起始识别复合物结合DNA ORC起始位点,招募解旋酶复制起始受严格调控,确保每个细胞周期MCM DNA只复制一次引物合成与延长聚合酶只能向已有核苷酸链的端添加核苷酸,因此需要引物DNA3RNA引发酶合成短引物,然后聚合酶以方向延长引Primase RNA DNA5→3物复制同时在两条模板链上进行,形成领先链连续合成和滞后链不连续合成,形成冈崎片段冈崎片段处理在滞后链上,引物被去除,空缺由聚合酶填补,RNA RNaseH DNAI然后连接酶将相邻冈崎片段连接起来这一过程确保复制的DNA DNA完整性复制过程中还有多种蛋白质参与,如单链结合蛋白稳定SSB单链区域,拓扑异构酶缓解超螺旋张力类型与功能RNA信使转运RNA mRNARNA tRNA携带从到蛋白质的遗传信息含有帽将氨基酸运送到核糖体的适配器分子呈DNA5子结构、非翻译区、编码区、典型的三叶草结构,含有反密码子环、环、5UTR D和多聚尾巴编码区由密码子组成,环和接受臂反密码子与上的密3UTR ATΨC mRNA每个密码子指定一个氨基酸或终止信号不码子配对,端接受特定氨基酸氨基酰3-同细胞类型表达不同的组,决定了细合成酶负责将正确的氨基酸连接到相mRNA tRNA胞的特性和功能应上,确保翻译准确性tRNA调控RNA核糖体RNA rRNA多种非编码参与基因表达调控微小RNA核糖体的结构和功能组分与蛋白质一起构和小干扰通过RNAmiRNA RNAsiRNA成核糖体亚基具有复杂的二级和三级结构,干扰抑制基因表达;长非编码RNA形成多个功能域参与定位、mRNA tRNA参与染色质修饰和转录调控;RNAlncRNA结合和肽键形成的催化活性的核糖酶rRNA小核参与前体剪接;RNAsnRNA mRNA活性证明了核糖体是一种核酶核仁小指导修饰RNAsnoRNA rRNA转录过程详解转录起始在启动子区域,转录因子与聚合酶结合形成转录起始复合物原核生物中,因子RNAσ识别启动子;真核生物中,基本转录因子如识别盒辅助聚合酶定TFIID TATARNA II位真核生物还有远端增强子、沉默子等调控元件转录延伸聚合酶沿模板链移动,按照碱基互补原则,合成新合成RNA DNAA-U G-C RNA的与模板形成短暂的杂合区,然后释放合成方向为,RNADNA RNA-DNA5→3解旋、合成和重新结合几乎同时进行DNARNADNA转录终止在终止子序列处,转录过程终止原核生物有依赖性和非依赖性终止;真核生物中,ρρ终止信号导致多聚信号识别,被切割并加上多聚尾巴聚合酶释放,可ARNAARNA进行新一轮转录加工真核生物RNA初级转录产物需要加工才能形成成熟端加帽甲基化鸟嘌呤核苷酸;内含mRNA5子剪接通过剪接体完成;端加多聚尾多腺苷酸聚合酶催化这些修饰对3AmRNA的稳定性、出核和翻译效率至关重要翻译机制简述翻译起始肽链延长翻译终止翻译起始是蛋白质合成的关键控制点原肽链延长是重复性过程,每次添加一个氨当位遇到终止密码子、或A UAAUAG核生物中,亚基识别上的序基酸位结合氨基酰由延长因子时,释放因子而非结合此30S mRNASD A-tRNA UGARF tRNA列和起始密码子,结合起始因子和起协助;肽基转移酶催化位点促使肽链从末端释放,水AUG EF-Tu/eEF1αP RFtRNA始tRNAᶠᴹᵉᵗ;真核生物中,40S亚基先结位肽链转移到A位氨基酸上;易位步骤中,解羧酰-tRNA酯键随后,核糖体解离因合起始因子束,然后扫描直到遇核糖体向端移动一个密码子,从子使核糖体亚基分离,各组分可重新用于eIF mRNA3tRNA A到最佳上下文的随后大亚基加入,位移至位,位移至位并可能释放新一轮翻译翻译过程消耗大量能量,每AUG PP tRNAE形成功能性核糖体或这一周期重复直至遇到终止密码子加入一个氨基酸至少消耗个高能磷酸键70S80S4基因表达的多层次调控表观遗传调控通过和组蛋白修饰影响染色质状态DNA转录水平调控2转录因子、增强子、沉默子共同控制基因转录加工调控RNA选择性剪接、编辑增加转录产物多样性RNA输出和稳定性RNA核质转运和降解途径控制寿命mRNA翻译与蛋白质修饰调控翻译效率和蛋白质修饰决定最终功能基因表达调控是一个多层次、高度协调的过程表观遗传修饰如甲基化和组蛋白乙酰化甲基化直接影响染色质开放状态,决定基因是否可被转录转录水平上,转录因子结合特定序DNA/DNA列激活或抑制转录;增强子可通过染色质环化远距离调控基因表达转录后水平,剪接、编辑和降解途径对进行精细调控近年来,非编码如的调控作用受到广泛关注,它们通过碱基互补配对靶向,抑制翻译或促进降解翻译水RNA mRNARNA miRNAmRNA平上,、结合蛋白和核糖体修饰共同调控蛋白质合成速率蛋白质合成后,磷酸化、乙酰化等修饰进一步调节其活性、定位和寿命这些多层次调控确保基因表达精确响应细胞内外miRNA RNA环境变化基因突变与修复机制常见突变类型修复机制修复缺陷与疾病基因突变可分为点突变和大片段突变细胞进化出多种修复机制应对不同修复系统缺陷与多种疾病相关例DNA DNA点突变包括碱基替换转换和颠换、碱基类型的损伤错配修复系统识别如,黑色素瘤性干皮病患者系MMR XPNER插入和缺失;大片段突变包括染色体断并修复复制过程中的碱基错配;碱基切统缺陷,导致对紫外线高度敏感;遗传裂、重排、片段缺失或重复等根据对除修复修复碱基化学修饰;核苷酸性非息肉性结直肠癌与BER HNPCCMMR蛋白质的影响,突变又可分为同义突变切除修复修复扭曲双螺旋的系统缺陷相关;乳腺癌相关基因NER DNA不改变氨基酸、错义突变改变氨基酸、大型加合物;双链断裂修复包括非同源参与修复,其突变显著增BRCA1/2HR无义突变产生终止密码子和移码突变末端连接和同源重组修复加乳腺癌和卵巢癌风险一些抗癌策略NHEJ HR改变阅读框两条主要途径正是靶向肿瘤细胞中的修复缺陷合成致死自发突变复制错误、脱氨基直接修复光复活酶、甲基鸟嘌核苷酸切除修复缺陷•DNA•O⁶-•XP作用呤甲基转移酶综合征解旋酶缺陷•Bloom RecQ诱导突变化学诱变剂、辐射、病毒切除修复、、••MMR BERNER错配修复系统缺陷•HNPCC整合双链断裂修复容易出错、•NHEJ准确HR细胞信号转导总览信号分子分类信号转导基本步骤主要信号通路细胞信号分子根据作用距典型信号转导包括接收、细胞内存在多条保守的信离分为内分泌远距离、旁传递和响应三个基本步骤号转导通路通路GPCR分泌近距离和自分泌同信号分子与细胞表面或胞通过蛋白和第二信使如G一细胞根据化学性质可内受体结合;受体构象改、⁺传递信号;cAMP Ca²分为胺类如肾上腺素、氨变激活下游信号分子;信通路激活RTK Ras-MAPK基酸衍生物如甲状腺素、号通过级联放大,最终导和等下游路径;PI3K-Akt肽类和蛋白质如胰岛素、致靶蛋白激活或抑制,引通路调控Wntβ-catenin类固醇如皮质醇和脂质衍起细胞生理响应信号转稳定性;通路JAK-STAT生物如前列腺素不同信导过程中,蛋白质相互作介导细胞因子信号;TGF-号分子通过特异性受体诱用、第二信使和蛋白质修通路通过蛋β/BMP Smad导不同的细胞响应饰如磷酸化起关键作用白调控基因表达这些通路之间存在复杂的交叉作用,形成信号网络受体及其分类细胞受体是信号转导的起点,根据结构和定位可分为膜受体和胞内受体膜受体主要包括
①蛋白偶联受体,特征为七次跨膜结构,通过蛋白传递信号;
②酪G GPCR G氨酸激酶受体,具有胞外配体结合区和胞内激酶结构域;
③离子通道受体,配体结合引起通道开放,允许特定离子流动;
④整合素,介导细胞与细胞外基质互作RTK胞内受体主要是核受体超家族,如类固醇受体和非类固醇受体它们结合脂溶性配体后转位至细胞核,调控基因表达不同受体有不同的信号放大机制,通过蛋白GPCRG和第二信使系统放大信号;通过级联磷酸化放大信号受体的数量和敏感性受负反馈调节,如脱敏和内化这种复杂的受体系统使细胞能够精确响应多种内外环境信号RTK蛋白偶联受体()信号G GPCR蛋白激活G受体激活蛋白是由、和三个亚基组成的异三聚Gαβγ配体如肾上腺素、乙酰胆碱等结合GPCR体活化的受体促使亚基释放并结GαGDP的胞外区域,引起受体构象变化七次跨合,导致与解离GTP GαGβγGα-GTP膜螺旋重排,导致胞内环区域变化,促使α和复合物均可调节下游效应分子主Gβγ蛋白与受体结合不同识别不同配G GPCR要蛋白亚型包括、、和,G GsGi GqG12/13体,启动特异性信号通路它们激活不同下游通路信号终止第二信使产生亚基具有酶活性,将水解为GαGTP GTP激活的蛋白调节效应器酶活性,产生第二G,导致与重新结合,信号终GDP GαGβγ信使激活腺苷酸环化酶,增加;Gs cAMP止蛋白偶联受体激酶磷酸化激活GRKG抑制腺苷酸环化酶;激活磷脂酶,Gi GqC的受体,促进结合,导致受体脱arrestin产生和;激活等小IP3DAG G12/13Rho敏和内化磷酸二酯酶降解,钙泵cAMP蛋白这些第二信使进一步激活下游蛋白G重新吸收胞质⁺,使第二信使水平恢复Ca²激酶如、等PKA PKC基线酪氨酸激酶受体()信号RTK配体结合与二聚化生长因子如、、胰岛素等结合的胞外域,诱导受体二聚化或构象变化这种二聚化是激活的关键步骤,使胞内激酶结构域相互接近不同EGF PDGFRTK RTK家族有不同的二聚化机制,如直接配体交联或受体介导的相互作用RTK自我磷酸化二聚化后,的胞内激酶结构域相互磷酸化对方的酪氨酸残基反式磷酸化这些磷酸化位点成为下游信号蛋白结合的对接站点磷酸化还可能激活激酶活性本RTK身,或解除抑制性结构域的限制磷酸化的具体位点决定了哪些下游信号分子被招募接头蛋白招募磷酸酪氨酸残基被含同源性或磷酸酪氨酸结合结构域的蛋白识别这些蛋白包括接头蛋白如、、信号酶如、和支架蛋白SH2Src2PTBGrb2ShcPI3K PLCγ它们的招募将信号传递到多条下游通路,是信号分叉和整合的关键点下游信号通路激活激活多条下游信号通路通路调控细胞增殖和分化;通路促进细胞存活和代谢;⁺通路调节细胞骨架重组和基因表达;RTK Ras-MAPK PI3K-Akt PLCγ-Ca²通路介导细胞因子信号这些通路之间存在交叉活化和抑制,形成复杂信号网络JAK-STAT信号终止信号通过多种机制精确终止蛋白酪氨酸磷酸酶去除磷酸基团;泛素连接酶介导受体内化和降解;诱导的磷酸酶如和抑制信号;RTK PTPE3PTEN SHIPPI3K和蛋白抑制通路失调的信号终止与多种疾病尤其是癌症密切相关Sprouty SPREDMAPK信号级联系统的细胞反应通路MAPK丝裂原活化蛋白激酶通路是保守的三级蛋白激酶级联系统包括、和三个主要分支MAPK ERK JNK p38主要响应生长因子,调控细胞增殖和分化;和主要响应应激刺激,调控炎症反应和细胞凋亡ERKJNKp38通路的输出通常是转录因子如、和的激活,进而调控基因表达模式MAPK Elk-1c-Jun ATF-2通路PI3K/Akt磷脂酰肌醇激酶被或激活后,催化生成,招募含结构域的蛋白如-3-PI3K RTKGPCR PIP3PH Akt和磷酸化激活,后者调控多种下游靶标抑制凋亡因子如,激活PDK1mTORC2Akt AktBAD mTORC1促进蛋白合成,抑制促进细胞周期进展,抑制转录因子通路是细胞生存和代谢调GSK3FOXO PI3K/Akt控的中心NF-κB通路核因子是关键炎症响应转录因子静息状态下,蛋白将二聚体如滞留在κBNF-κB IκB NF-κBp50/p65细胞质中受体如受体、激活复合物,后者磷酸化导致其降解释放的转位至核TNF TLRIKK IκB NF-κB内,启动目标基因转录,包括炎症因子、趋化因子和抗凋亡蛋白等通路是先天性免疫反应的核心NF-κB调节器通路JAK/STAT激酶信号转导和转录激活因子通路主要介导细胞因子信号细胞因子结合受体后使Janus JAK/STAT相互接近和激活,磷酸化受体和磷酸化形成二聚体,转位至核内调控基因表达不同JAK STAT STAT调控不同生物过程主要介导抗病毒反应,促进细胞存活,参与造血细胞STATSTAT1/2STAT3STAT5发育信号调控失常与疾病肿瘤中的信号通路异常糖尿病中的信号通路异常神经退行性疾病中的信号异常癌症中常见多种信号通路异常激活型糖尿病特征是胰岛素抵抗和胰岛素信号阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾RAS2基因突变约人类肿瘤导致持续活化通路障碍常见机制包括胰岛素受体底物病与多种信号失调相关神经营养因子信30%的蛋白;过表达或突变导致不的丝氨酸磷酸化抑制正常酪氨酸磷酸号如减弱导致神经存活能力RAS EGFRIRSBDNF-TrkB依赖配体的激活;抑癌基因缺失导致化;蛋白上调抑制通路;下降;钙信号失调引起兴奋性毒性;PTEN SOCSJAK/STAT Wnt通路过度活化;通路持炎症因子激活和,抑制胰岛素信信号异常与淀粉样蛋白沉积有关;炎症PI3K/Akt NF-κB JNKIKKβ-续激活促进炎症相关肿瘤发生靶向这些号;等磷酸酶上调,去磷酸化胰岛信号通路持续激活导致神经胶质细胞激活PTP1B异常信号通路的药物如酪氨酸激酶抑制剂素受体和这些改变共同导致胰岛素信和神经炎症深入理解这些异常有助于开IRS已成为癌症治疗的重要策略号减弱,影响葡萄糖摄取发新型神经保护药物生物学正反馈与负反馈负反馈机制正反馈机制反馈调控的生理意义负反馈是生物系统中最常见的调控模式,正反馈是系统输出增强输入的过程,导生物体内的反馈调控确保各种生理过程其特征是系统输出抑制输入,维持系统致两种可能结果放大效应或双稳态切的精确控制和稳定运行体温调节中,稳态内分泌系统中,甲状腺激素抑制换细胞周期中,和相互体温升高触发出汗和血管扩张的负反馈;Cdk1CyclinB分泌;糖代谢中,和柠檬酸抑激活形成正反馈;血液凝固中,凝血因血糖调节中,胰岛素和胰高血糖素形成TSH ATP制磷酸果糖激酶活性;信号转导中,子级联放大初始信号;神经元动作电位拮抗性反馈环;创伤修复中,血小板聚通路激活诱导磷酸酶表达,中,电压门控钠通道的激活进一步去极集和凝血因子激活形成正反馈反馈失MAPK DUSP去磷酸化并失活化膜电位正反馈常与负反馈配合,实调是多种疾病的病理基础,如自身免疫MAPK现复杂的时空调控病中的持续炎症正反馈稳定性减小波动,维持稳态•放大小信号转变为强烈响应稳态维持如血压、血糖、体温适应性对持续刺激逐渐减弱响应•••双稳态系统在两种状态间切换资源分配根据需求分配能量响应速度加快系统达到平衡的速度•••不可逆性超过阈值后难以逆转发育决策细胞命运确定和器官形成••细胞间的信息传递化学突触化学突触是神经元间主要的信息传递方式突触前神经元释放神经递质分子,跨过突触间隙,与突触后神经元上的受体结合这一过程包括动作电位到达轴突末梢,电压门控钙通道开放,钙离子内流触发突触小泡与细胞膜融合,释放神经递质根据引起的效应,化学突触可分为兴奋性如谷氨酸和抑制性如GABA电突触电突触通过间隙连接实现神经元间的直接电流传导间隙连接由蛋白形成的六聚体构成,两个细胞的六聚体对接形成通道,允许离子和小分子直接通过connexin≤1kDa与化学突触相比,电突触传递速度更快,延迟更短,能够同步大量神经元活动在心肌、平滑肌和某些神经环路中,电突触对维持同步活动至关重要细胞粘附分子细胞粘附分子介导细胞间识别和附着,对信息传递和组织形成至关重要主要类型包括钙依赖性钙粘蛋白、免疫球蛋白超家族、选择素和整合素这些分子不CAMs CAMs仅提供物理连接,还能触发胞内信号转导例如,神经元钙粘蛋白参与突触可塑性,和介导白细胞与内皮细胞互作,促进免疫细胞迁移N-cadherin VCAMICAM细胞分化机制多能性维持胚胎干细胞维持多能性依赖于核心转录因子网络,包括、和这些因子相互激活并Oct4Sox2Nanog协同调控大量基因,维持多能性状态并抑制分化基因表达表观遗传修饰如组蛋白甲基化活化H3K4标记和低甲基化水平对多能性维持也至关重要外部信号如和通路支持干细DNA LIF-STAT3Wnt胞自我更新分化启动分化启动需要多能性基因表达下降与谱系特异性基因激活分化信号如、或通过细胞BMP FGFNotch表面受体激活细胞内信号级联,改变转录因子活性多能性核心网络被干扰,导致表观遗传重编程,包括甲基化增加和组蛋白修饰变化启动基因被选择性活化,特异性转录因子开始主导细胞命运DNA谱系决定谱系决定涉及主控转录因子的表达,它们作为决定特定细胞命运的分子开关例如,启动肌肉MyoD分化,促进红细胞生成,控制眼发育这些因子激活组织特异性基因网络,同时抑制替GATA1Pax6代命运细胞命运决定后,表观遗传修饰进一步巩固分化状态,使特定基因集持续表达分化终端巩固细胞完全分化后,通过多种机制巩固其分化状态持续表达组织特异性转录因子和下游基因;建立稳定的表观遗传修饰模式甲基化和组蛋白修饰;染色质重塑维持基因表达模式;自分泌信号加强DNA分化状态这些机制使分化通常不可逆,但在某些情况下,转分化或重编程可突破这一限制免疫应答机制抗原识别细胞通过膜结合抗体直接识别抗原,包括蛋白质、多糖、脂质等;细胞通过细胞受体B BCR T T识别抗原呈递细胞表面分子呈递的抗原肽段抗原识别是特异性免疫应答的起始步骤,TCR MHC由受体多样性提供的广泛识别能力和信号转导启动免疫级联反应免疫细胞活化和扩增细胞活化需要两种信号识别抗原和辅助细胞提供的辅助信号如活化的细胞增B BCRTCD40L B殖形成胚中心,进行体细胞高频突变和亲和力成熟细胞活化需要信号、共刺激信号T TCRCD28-和细胞因子活化后的免疫细胞克隆性扩增,产生大量效应细胞和记忆细胞B7浆细胞分化与抗体产生活化的细胞分化为浆细胞和记忆细胞浆细胞是抗体工厂,通过转录因子如和B BBlimp-1XBP-1的作用,重编程为专门分泌抗体的细胞浆细胞扩展内质网,大量合成和分泌抗体抗体通过多种机制发挥保护作用中和病原体、激活补体系统、促进吞噬作用和抗体依赖性细胞毒性ADCC免疫记忆形成部分活化的细胞和细胞分化为长寿命记忆细胞,构成免疫记忆的基础记忆细胞表达高亲和力B T B,在二次遇到同一抗原时迅速活化;记忆细胞分为中央记忆和效应记忆亚群,分别定居于淋BCRT巴组织和外周组织免疫记忆使二次免疫应答更迅速、更强烈、更有效,是疫苗保护作用的基础体液与细胞免疫调控体液免疫特点细胞免疫特点协同机制体液免疫以细胞产生的抗体为主要效应细胞免疫以细胞为核心,包括辅体液免疫和细胞免疫密切协作,形成完B T CD4+分子,针对体液中和细胞外空间的病原助细胞和细胞毒性细胞整的适应性免疫网络辅助细胞T CD8+TCD4+T体抗体分为五类、、、细胞分泌细胞因子,调控其他免通过接触和细胞因子信号协助细胞活化、IgG IgMIgA CD4+TB、,各有特殊功能和分布抗体疫细胞;细胞直接杀伤被感染细分化和抗体类别转换;抗体通过与受IgE IgDCD8+T Fc通过识别病原体表面抗原,发挥中和、胞或肿瘤细胞细胞免疫对胞内病原体体结合,增强巨噬细胞和细胞的效应NK激活补体、促进吞噬和等功能如病毒、胞内细菌和肿瘤监视尤其重要功能;补体系统连接两种免疫形式,既ADCC体液免疫对细菌感染和毒素尤其重要,细胞和巨噬细胞等也是细胞免疫的重可被抗体激活,又能促进细胞免疫反应NK在病毒进入细胞前也能发挥作用要组成部分这种协同确保了对各类病原体的有效防御针对细胞外病原体针对胞内病原体和肿瘤••促进细胞免疫,促进体液免可跨胎盘,提供被动免疫不能跨胎盘传递•Th1Th2••疫可通过疫苗有效诱导难以通过常规疫苗诱导••树突状细胞桥接两种免疫反应•细胞因子网络协调整体免疫响应•应激与稳态调控大脑感知与整合大脑感知内外环境变化并整合各类信号神经内分泌激活-下丘脑分泌等神经肽,激活垂体肾上腺轴CRH-免疫系统相互作用应激激素调节免疫功能,免疫分子反馈影响大脑稳态修复多层次反馈调控恢复生理平衡神经内分泌免疫网络是机体应对压力和维持稳态的核心系统当机体面临各类应激源物理的、心理的或生理的时,大脑尤其是下丘脑感知这些信号,激活两条主要应激--通路
①交感神经肾上腺髓质轴,释放儿茶酚胺肾上腺素和去甲肾上腺素;
②下丘脑垂体肾上腺皮质轴轴,释放糖皮质激素如皮质醇---HPA这些应激激素通过广泛表达的受体调节几乎所有组织的功能在免疫系统中,糖皮质激素主要抑制炎症反应,而儿茶酚胺则有更复杂的调节作用反过来,免疫细胞产生的细胞因子如、、可穿过血脑屏障或通过迷走神经传入信号,影响大脑功能慢性应激可导致这一网络失调,与多种疾病如抑郁症、自身免疫病和代谢综IL-1IL-6TNF-α合征相关细胞因子风暴是炎症失控的极端例子,可见于严重感染和某些免疫治疗后生理节律生物钟机制——环境光信号输入分子振荡器光线通过视网膜特殊感光神经节细胞神经元内部存在分子振荡器,由转录SCN-接收,这些细胞表达光敏色素黑翻译负反馈环路组成核心成分包括ipRGC视蛋白光信号通过视交叉上核束传到下和正调节因子以及CLOCK BMAL1PER丘脑的视交叉上核,是哺乳动和蛋白负调节因子SCN SCNCRYCLOCK-物的主要生物钟中枢光是最强的昼夜节二聚体促进和基因转录;BMAL1PER CRY2律同步信号,帮助生物钟与外界环境周期和蛋白逐渐积累后抑制PER CRYCLOCK-保持一致活性,形成大约小时的分子振BMAL124荡全身同步与协调信号输出作为主时钟,协调各外周振荡器,保通过神经连接和内分泌信号将节律信SCN SCN持全身生理功能的时间同步这种协调对息传递给全身重要输出途径包括对松果代谢、免疫、内分泌和神经行为功能至关体褪黑素分泌的调控和对交感神经系统的重要除光照外,进食时间、温度和运动影响褪黑素在暗环境中分泌增加,促进等也能调节外周生物钟,这解释了时差反睡眠并抑制活性,形成反馈调节几SCN应和倒班工作的生理影响,以及时间限制乎所有外周组织也表达生物钟基因,形成性进食的代谢效应外周振荡器细胞衰老与死亡机制复制性衰老正常体细胞经过一定次数分裂后进入永久性增殖停滞状态,称为复制性衰老主要机制是端粒逐渐缩短至临界长度,激活损伤反应端粒是染色体末端的重复序列,保护染色体完整性每次复制,DNA DDRDNA端粒因末端复制问题而缩短干细胞和生殖细胞表达端粒酶维持端粒长度,而大多数体细胞不表达端粒酶,导致端粒逐渐缩短,最终引发衰老应激诱导衰老细胞在遭受亚致死性应激后也可进入衰老状态,称为应激诱导衰老常见诱因包括氧化应激、损伤、DNA致癌基因激活和表观遗传改变这类衰老不一定依赖端粒缩短,但下游信号通路与复制性衰老相似,如和通路激活,导致细胞周期阻滞应激诱导衰老可能是机体抑制受损细胞增殖的保护机p53-p21p16-Rb制,防止肿瘤发生衰老相关分泌表型衰老细胞不仅停止分裂,还表现出显著的代谢和分泌改变,统称为衰老相关分泌表型组分包SASP SASP括炎症因子、、生长因子、蛋白酶和细胞外基质修饰蛋白等这些因子可影响周围组织微环境,IL-6IL-8导致组织功能紊乱,促进炎症和可能的肿瘤生成靶向清除衰老细胞使用药物或抑制已成senolyticsSASP为延缓衰老相关疾病的新策略自噬与细胞死亡自噬是细胞降解自身成分的过程,在正常生理和病理条件下都发挥重要作用基础自噬水平维持细胞器质量和蛋白质平衡;应激诱导自噬则提供能量和营养,促进细胞存活然而,过度自噬可导致自噬性细胞死亡随着年龄增长,自噬能力下降,导致受损蛋白和细胞器积累,加速衰老增强自噬在多种模式生物中显示出延缓衰老的效果,提示自噬调节是抗衰老的潜在靶点生物体力学机制简析生物本构规律骨组织力学特性软组织力学特性生物本构规律描述材料在应力作用下的骨是人体最硬的组织,由有机主要是胶软组织如肌肉、肌腱、韧带力学特性与变形关系与工程材料不同,生物组织原和无机羟基磷灰石成分组成骨的其结构和功能密切相关肌肉具有主动通常表现出复杂的力学行为,包括非线微观结构如骨小梁排列决定了其宏观力收缩特性,由肌球蛋白与肌动蛋白滑行性、各向异性、粘弹性和触变性本构学特性骨具有显著的各向异性,沿载产生;肌腱和韧带富含平行排列的胶原方程是描述这些特性的数学模型,对不荷主轴方向强度最大骨在生理条件下纤维,提供高抗拉强度;软骨含大量蛋同组织有特定形式例如,血管壁常用不断重塑,遵循定律骨结构调整白聚糖,在载荷下产生流体压力,吸收Wolff超弹性模型如方程描以适应受力状态骨密度、微结构和矿冲击软组织普遍表现出粘弹性应力Mooney-Rivlin-述;软骨则需要考虑固流相互作用的双化程度是决定骨强度的关键因素,骨质应变关系依赖于时间和应变硬化大变形-相模型这些模型对理解组织功能和疾疏松症患者这些参数恶化导致骨折风险下变得更硬软组织力学特性改变与多病机制至关重要增加种疾病相关,如肌肉萎缩、韧带松弛和软骨退变生物体流变学特性血液流变学基本特性心血管流体力学血液是典型的非牛顿流体,其粘度不恒定,取决于血液在血管系统中的流动遵循流体力学原理大血剪切率、血细胞浓度和血管直径该特性称为剪切管中流动接近层流,而在分叉和狭窄处可出现涡流稀化,在剪切率增加时粘度降低,有利于血液在小血管弹性使脉搏波沿血管传播,动脉硬化导致波速血管中流动血液流变学特性主要由红细胞决定,增加心脏作为泵,产生压力差推动血液循环,左红细胞变形能力对微循环至关重要心室压力容积关系反映心脏功能状态-血细胞比容红细胞压积是血液粘度的主要决泊肃叶定律流量与压差和管径四次方成正比••定因素血管顺应性单位压力变化引起的容积变化•纤维蛋白原增加导致红细胞聚集,增加血液粘•数决定流动是层流还是湍流•Reynolds度红细胞变形能力降低如镰状细胞病严重影响•微循环流体力学与疾病流体力学异常与多种心血管疾病相关动脉粥样硬化倾向发生在低剪切应力和流体扰动区域;高血压增加血管壁应力,促进血管重构;心脏瓣膜疾病改变血流动力学,如主动脉瓣狭窄导致流速增加和压力梯度理解这些机制对疾病诊断和治疗至关重要血管狭窄处的高剪切力可激活血小板,促进血栓形成•湍流会损伤血管内皮,是动脉粥样硬化的始动因素•流体力学参数如分数流量储备指导冠脉干预治疗•FFR组织工程与生物材料机制人工心脏瓣膜是组织工程与生物材料应用的典型案例,其设计需平衡多种要求机械瓣膜通常由聚碳酸酯、热解碳或钛合金制成,具有优异的耐久性可使用年,20-30但需终身抗凝治疗生物瓣膜则使用经戊二醛处理的猪瓣或牛心包组织,具有更好的血流动力学性能和较低的血栓风险,但耐久性较差年10-15理想的瓣膜材料应具备
①优异的血液相容性,不诱导凝血和血栓形成;
②足够的机械强度,耐受每分钟次的循环负荷;
③合适的弹性,最小化能量损失;
④耐60-100疲劳性和耐钙化性;
⑤对内皮细胞的良好支持组织工程瓣膜是新兴方向,结合可降解支架和自体细胞,旨在创造可生长、可重塑的活性瓣膜,特别适用于儿科患者材料表面微观结构和化学修饰对瓣膜性能有决定性影响典型机制案例胰岛素分泌调控1血糖感应血糖通过转运蛋白进入细胞,被葡萄糖激酶磷酸化开始代谢这一步是感应血糖GLUT2β水平的速率限制步骤,葡萄糖激酶被称为血糖传感器细胞内葡萄糖代谢增加,比率升高,为下一步提供信号ATP/ADP离子通道调控敏感性钾通道关闭,导致细胞膜去极化这触发电压依赖性钙通道开放,钙离ATP KATP子内流某些磺脲类药物如格列本脲直接结合并关闭通道,绕过葡萄糖代谢步骤,KATP刺激胰岛素释放胰岛素囊泡释放细胞内钙浓度升高触发胰岛素囊泡与细胞膜融合这一过程依赖蛋白复合物包括SNARE、突触素等和多种调节蛋白如释放过程分两相第一相是预制胰岛SNAP25Munc18素的快速释放;第二相涉及新合成的胰岛素4反馈调节释放的胰岛素通过作用于靶组织降低血糖,形成负反馈环细胞本身也表达胰岛素受体,β胰岛素可自分泌调节细胞功能高血糖长期存在可导致细胞功能障碍糖毒性,ββGLP-1等肠促胰岛素激素可增强葡萄糖刺激的胰岛素分泌典型机制案例传染病流行机制2₀R基本再生数每个感染者平均传染的易感者数量,决定疫情是否蔓延λ力度系数单位时间内易感个体受到的有效接触次数D世代时间从一个感染者被感染到他传染其他人的平均时间间隔H异质性系数量化个体传播力差异,高值表明超级传播者现象显著传染病流行遵循特定的动力学规律,可通过数学模型描述和预测经典的模型将人群分为易感、感染和恢复三组,通过微分方程描述其随时间变SIR SI R化扩展模型还可包括潜伏期模型、免疫衰减模型和人口结构等因素这些模型有助于评估干预措施效果,如疫苗接种临界覆盖率估算SEIRSIRS宏观流行动力学由微观传播机制决定病原体特性如稳定性、传播途径、宿主因素如易感性、行为模式和环境因素如温度、湿度共同影响传播效率网络模型表明,传播网络结构对疫情演变至关重要高度连接的节点如超级传播者对疾病蔓延影响显著理解这些机制对制定精准防控策略、优化资源——分配和改进监测系统至关重要,也有助于开发更有效的疫苗接种策略典型机制案例癌症发生的分子机制3基因组稳定性破坏癌症发生的初始事件通常是损伤或修复系统失效致癌因子如紫外线、化学致癌物、DNA病毒可直接损伤;遗传性癌症综合征常涉及修复基因如突变这导DNA DNABRCA1/2致突变累积速率增加,为后续癌变奠定基础表观遗传异常如全局低甲基化也会导致DNA基因组不稳定基因组不稳定性是肿瘤进化的驱动力关键信号通路紊乱随着突变积累,癌细胞获得生长优势原癌基因如、突变导致过度活化,促RAS MYC进细胞增殖;抑癌基因如、失活,消除细胞周期检查点和凋亡机制TP53RB通路过度活化促进细胞存活;通路异常激活支持干PI3K/AKT/mTOR Wnt/β-catenin细胞特性;和通路失调影响分化这些关键通路的紊乱共同导致细胞Notch Hedgehog增殖失控微环境重塑与转移癌细胞与周围基质细胞、免疫细胞和血管相互作用,重塑肿瘤微环境上皮间质转-化使癌细胞获得迁移能力;基质金属蛋白酶分解细胞外基质,便于侵袭;血管EMT内皮生长因子促进新生血管形成;免疫检查点分子如帮助癌细胞逃VEGFPD-L1避免疫监视微环境改变不仅支持原位肿瘤生长,还为远处转移创造条件,是肿瘤恶性进展的关键步骤前沿进展人工智能在生物机制研1究的应用生物数据挖掘结构预测与药物设计合成生物学应用人工智能技术,特别是深度等系统在蛋合成生物学结合技术开启AlphaFold2AI AI学习方法,已成为处理大规白质结构预测领域取得突破了生物系统工程化的新时代模生物数据的强大工具机性进展,准确度接近实验方机器学习算法可优化代谢通器学习算法能从基因组、转法这些工具极大扩展了我路设计,指导基因线路构建,录组、蛋白质组等多组学数们对蛋白质结构功能关系的预测生物元件组合效果这-据中识别模式和关联,发现理解,为新靶点发现提供基使得工程化细胞工厂生产药传统方法难以察觉的生物标础在药物设计领域,辅物、生物燃料、特种化学品AI志物和调控网络例如,卷助的虚拟筛选和分子生成算成为可能基因编CRISPR积神经网络可从序列中法加速了先导化合物发现,辑技术与预测工具结合,DNA AI预测转录因子结合位点,循显著缩短药物开发周期生提高了基因编辑精度和效率,环神经网络可预测二级成式还能设计全新分子,降低脱靶效应微生物群落RNA AI结构这些方法极大加速了扩展化学空间,为难治疾病设计和定向进化实验也从AI从海量数据到机制洞察的转提供创新药物辅助分析中获益,加速了理化想表型的筛选前沿进展单细胞组学与精准医学2单细胞技术革新组织微环境解析精准医学应用单细胞组学技术突破了传统组学研究中单细胞技术结合空间转录组学方法,实单细胞组学驱动精准医学发展,特别是的平均效应限制,能够在单个细胞水平现了对组织微环境的高分辨率解析这在疾病异质性和个体化治疗方面在肿揭示生物异质性单细胞测序些方法保留了细胞的空间位置信息,揭瘤学中,单细胞分析揭示了肿瘤进化轨RNA可绘制细胞类型图谱,发示了复杂组织中的细胞交互网络例如,迹和耐药机制,指导靶向治疗和免疫治scRNA-seq现新的细胞亚群;单细胞分在肿瘤研究中,这些技术绘制了免疫细疗策略;在自身免疫疾病研究中,识别ATAC-seq析染色质可及性,揭示表观调控机制;胞浸润图谱,发现了肿瘤微环境中的免了关键致病细胞亚群和疾病特异性生物单细胞多组学联合分析整合不同层次信疫抑制机制;在神经科学领域,空间转标志物;在感染病学中,阐明了宿主病-息,提供更全面视角微流控技术、条录组学揭示了神经元连接模式和功能区原相互作用的细胞特异性响应这些洞形码标记和纳米孔测序等创新方法显著划;在发育生物学中,这些方法追踪了察为开发更精准的诊断工具和个体化治提高了通量和精度,使百万级单细胞分细胞命运决定的时空动态疗方案提供了基础,推动医学从一刀切析成为可能向精准干预转变课程内容复习与小结能量与物质代谢分子与细胞基础代谢网络是生命活动的动力来源我们详细讨论了糖的有氧氧化、循环、电子传递链等能量我们从生物分子核酸、蛋白质、糖脂和细胞结构TCA代谢途径,以及蛋白质、脂质代谢的关键过程开始,理解了生命活动的物质基础细胞是生命这些途径通过精密的酶促反应网络相互连接,形的基本单位,其结构和功能分化为生命活动提供成生物体内物质和能量转换的完整体系了基础框架细胞周期和凋亡机制确保了细胞数量和质量的平衡,是多细胞生物体发育和稳态的遗传信息传递基础遗传信息的存储、复制、转录和翻译构成生命的核心流程复制保证了遗传信息的准确传递;DNA3基因表达的多层次调控使细胞能适应环境变化;突变与修复机制在维持基因组稳定性和推动进化系统调控机制变异间取得平衡5在更高层次上,我们探讨了免疫系统、神经内分-信号转导网络泌网络、生物钟等系统层面的调控机制这些系4信号转导是细胞感知和响应环境变化的关键机制统通过复杂的反馈环路和信息交流网络,维持机我们研究了受体类型、蛋白和酪氨酸激酶信号通体整体功能的协调与稳定,是理解生命整体性的G路,以及细胞内级联反应网络这些复杂的信号关键网络使细胞能够整合多种信息,协调做出适当的生理响应思考与讨论题机制研究的方法论思考前沿领域待解机制生物学机制研究涉及多种技术和方法,请分析基因敲除、抑制性、尽管生物学研究取得巨大进展,仍有许多关键机制尚未完全阐明例RNA小分子抑制剂和光遗传学等方法各自的优势和局限如何结合多种方如,干细胞多能性维持与分化决策的精确调控、复杂行为的神经环路法互补验证同一机制?在研究新发现的生物学机制时,你会设计怎样基础、生物节律与代谢的耦合调控等请选择一个你感兴趣的未解机的实验路线以建立因果关系?制,提出可能的研究思路和实验设计机制整合与系统思维机制障碍与疾病治疗单个生物学机制很少独立作用,通常与其他机制形成网络请尝试整许多疾病本质上是正常生物学机制的障碍或失调请选择一种常见疾合本课程中学习的至少三个不同层次的机制如分子、细胞、系统层面,病如糖尿病、癌症、神经退行性疾病等,分析其病理机制与正常生理分析它们如何协同作用以维持特定的生理功能例如,运动时肌肉能机制的偏离,并据此讨论现有治疗策略的作用机制和局限你能提出量供应、免疫应答或昼夜节律对代谢的调控等基于最新机制研究的新型治疗思路吗?致谢与参考资料本课程内容的编写参考了众多经典教材、最新研究文献和数据库资源核心参考教材包括《分子生物学原理》等、《生物化学》Alberts、《细胞信号转导》等以及《生理学》最新研究进展主要参考、、等期Lehninger GompertsGuytonHall NatureScience Cell刊近五年发表的研究论文,以确保内容的前沿性和准确性特别感谢各位同行在课程编写过程中提供的宝贵建议和反馈感谢实验教学中心提供的精美图片和教学资源支持我们鼓励学生进一步探索国家自然科学基金委、科技部等机构支持的相关数据库和知识库,如、、等,这些开放资源对深入理解生物学机制NCBI UniProtKEGG具有重要价值如对特定主题有更深入的兴趣,请随时与任课教师联系,我们很乐意提供更多专业指导和研究建议。
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