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文本内容:
植物总的提取及RNA RT-PCR生物学实验技术植物总的提取及RNA RT-PCR
一、实验目的学习从植物组织中提取总的方法1,RNA了解的基本原理和实验方法2,RT-PCR
二、实验原理提取的原理
1.RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的必须最大限RNA RNA,度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对的降解RNA高浓度强变性剂异硫氧酸月瓜可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活酶,所以从细胞中释放出来时RNA RNA不被降解细胞裂解后,除了还有、蛋白质和细胞碎RNA,DNA片,通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、均一的总RNAo的原理
2.RT-PCR提取组织或细胞中的总以其中的作为模板,采用RNA,mRNA作引物利用逆转录酶反转录成再以为模板OligodT cDNAcDNA进行扩增,获得目的基因或检测基因表达使PCR RT-PCR RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量样品分析RNA成为可能该技术主要用于分析基因的转录产物、获取目的基因和合成探针等cDNA
三、仪器、药品与试剂配方一仪器及器皿低温离心机;琼脂糖凝胶电泳系统;高压灭菌锅;
1.
2.
3.仪;研钵;.一次性手套等;
4.PCR
5.6离心管;.培养皿;烧杯及试剂瓶等
7.
89.二药品焦碳酸二乙酯异硫鼠酸月瓜醋酸钠
1.DEPC
2.GT
3.NaAc苯酚异丙醇氯仿4,
5.6,乙醇筑基乙醇琼脂糖7,
8.0—9,反转录试剂盒聚合酶引物
10.MLV ll.TaqDNA12,三试剂配制水灭菌
1.
0.1%DEPC异硫氟酸月瓜
2.4mol/L灭菌
3.2mol/L NaAcpH
4.8灭菌
4.3mol/L NaAcpH
4.8灭菌
5.4mol/L LiCI缓冲液
6.lxTE10mM Tris-HCI pH
8.0,1mM EDTA灭菌pH
8.0,
四、实验步骤一总的提取RNA研钵冷却后,倒入液氮,加入植物材料,充分12/
30.2g研磨后转入一个含有300的的的聚丙烯管中,摇匀I4MGT L5ml加入摇匀,加入酸酚水23012M NaAcpH
4.9-
5.2300I饱和酚pH
5.0,生物学实验技术摇匀,加入三氯甲烷,摇匀1001年离心吸取上清,加入等体积3120XX rpm4C20min,异丙醇,于冰上放置15min年离心将沉淀悬浮于含4120XX rpm4c10min,100I4M氯化锂的管
1.5ml EP中,于放置小时或更长时间-20C1年离心将沉淀溶于5120XX rpm4C10-15min,
0.4水中,加入体积mIDEPC1/2氯仿和体积酸酚,摇匀,进行抽提,年离1/2120XX rpm4C°心;上清加入等体积氯仿,摇匀,进行抽提,年5min120XX rpm4c离心5min上清液加入体积的乙酸钠和两倍体积的无61/103M水乙醇于放置小时或更长时间-20C1年离心超净台吹干,沉淀溶于7120XX rpm4C15min,灭菌的口£「水中101133贮于8RNA-80C二反转录产生RNA cDNA在处理过的离心管中冰上按下表加入DEPC模板RNAOligdT18水DEPC2I1I2I混匀,水浴中放置立即放置到冰上然后70C2min,2min在冰上依次加入RNasinM-MLV5x buffer10mM dNTP
0.5I1I2I
1.5I水浴中反应终止反应42C°,90min72C°,10min,加入的灭菌水,使总体积达到15I DEPC251三PCR.在灭菌的管中加入以下成分,形成反应体系1PCR PCR10X buffer2,5I dNTP
2.5mmol2I产物RT-PCR5I酶Taq
0.5I上游引物10mol/l
0.5I下游引物10mol/l
0.5I灭菌力口至ddH20U25I.按照下列条件进行反应2PCR94C°5min94C°30s55C°30s72C°1min个循环3072C°7min4C°四电泳检测将加的%变性琼脂糖凝胶放入水平电泳槽中,加电EB1lxTE泳缓冲液,覆盖凝胶约将及样品加到凝胶点样1mm RNADNA孔中,条件下电泳在紫85V30min,生物学实验技术外灯下观察结果
五、注意事项在研磨过程中,利用液氮时刻使组织保持冰冻状态
1.酶是一类生物活性非常稳定的酶类,除了细胞内源
2.RNA酶外,外界环境中均存在酶,所以操作时应戴手套RNA RNA.使用时,应在通风橱中戴手套操作3DEPC提取用品准备
4.RNA)普通的玻璃器皿烘干小时(玻璃),研钵,小勺,1180C8试剂瓶若干个)一次性使用的塑料制品枪头、管等先用水处理2EP DEPC然后高压灭菌,烘干)电泳槽去污剂洗干净,水冲洗,彻33%H2O,
0.1%DEPCzk底冲洗)用烘烤过的药勺称取试剂4)用水配制试剂水至少处理5DEPC
0.1%DEPC37C12小时,高压灭菌15min)含有一类的缓冲液,不可用处理6Tris DEPC。
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