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路);⑵K d1:凝胶对溶质分子可能有吸附作用(疏水、亲和、静电作用)Gel得定义:含大量液体得具有三维网状开孔弹性结构得多聚体结构,一般制成球状颗粒Gel得要求⑴多孔、孔隙区大,内水体积力要大;亲水;
(3)惰性;
(4)稳定;
(5)色谱性能好交联葡聚糖(Sephad e x):交联丙烯基葡聚糖(Sephacryl)
(一)结构一)结构■骨架:葡聚糖(d ext ran)■单体:烯丙基右旋糖首■主键:a-l,6糖普键(约95%)■交联剂:N,N-甲叉双丙烯酰胺■分支oc-1,3糖昔键(约5%)■凝胶:较硬,强度大■交联剂:环氧氯丙烷,以醵键交联■型号:Sephacryl S-200,S-300,S-400,S-500,S-1000型号愈控制葡聚糖与交联剂比例可制造不同孔径凝胶高,孔径愈大,其分子量分离范围可查表G-X可表示型号,X从10—200
(二)稳定性其数字表示10g干胶得吸水量mL■pH2〜11
(二)稳定性■较S ephadex抗压
1、化学性质:较稳定
(三)色谱性能其稳定pH范围2〜12■工作范围1()00〜7亿■强酸下,凝胶糖普键易水解■吸附性
10、05mo1/L■强碱下,羟基易氧化成酸琼脂糖凝胶(Scphar OS c)■一般稀碱下相对稳定,可用稀碱清洗一)结构
2、物理性质■3-D-半乳糖和3,6-脱水・L.半乳糖交替结合所形成得线性■对热较稳定,可进行高温灭菌多聚糖■耐压性与凝胶型号有关■糖浓度越大,网孔越小
(三)色谱性能■型号Sep haroSc2B、4B、6B表示糖浓度2%3Bio-Gel A
0、5〜150M表示工作范
1.组别分离A类与B类、B类与C类、A类与C类间分子量:100Da
2、〜60万Da
2.分级分离B类分子间得分离吸附作用围上限■离子性
(二)稳定性■芳香性(疏水)
1、化性聚丙烯酰胺(Bio-G el一)p-x稳定pH范围
4、5〜
9、0结构
2、物性■单体:丙烯酰胺CH2=CH—CONH2■交联剂:N,N-甲叉双丙烯酰胺■抗热性:较差,只能在0〜45℃使用■抗压性:较好,与浓度有关CH2=CH-CONH-CH2-NHCO-CH=CH2
(三)色谱性能■型号B io—G e1p—x中,x范围2〜300■总工作范围103〜4X107(4000万)其中x二工作范围上限/1000■吸附性I
0、02mol/L
(二)稳定性交联琼脂糖(Sc phar ose CL-X B)
1、化性㈠结构稳定pH范围2〜11强碱条件下用2,3一二便丙醇或环氧氯丙烷进行交联
2、物性㈡稳定性同Se phadex■化性:pH3〜14
(三)色谱性能■物性:抗热、抗压均提高
1、总工作范围100〜40万㈢色谱性能
2、吸附:离子
10、02m o1/T.■工作范围同S cpharose凝胶过滤色谱应用■吸附性:下降㈠、分离分子量测定:需先作标准曲线,常用Ve—IgMw凝胶过滤色谱实验设计要点
1.高分辨率;
2.回收率高(减少峰宽,可提高回收率);
3.减少稀释;
4.短时间凝胶过滤色谱应用举例:脱盐;缓冲液交换;测定多聚物得分子量分布;混合物得分级分离;蛋白质得复性离子交换层析I EC原理:因溶质分子带不同性质电荷和不同电荷量,可在固定相和移动相之间发生可逆交换作用而使溶质移动速度变化,从而达到分离目得得技术离子交换剂就就是离子交换技术得核心和基础■改变缓冲液条件,使Pr从柱上解吸;■基质:母体和骨架,水不溶性化合物■收集洗脱液,测定出其总Pr,用此总P r除以离子交换■功能基团:共价结合在基质上剂体积可算出该交换剂在此流速下动态容量■反离子(平衡离子):与功能基团带相反电荷离子交换层析得本质功能基团决定了离子交换剂得基本性质☆起始条件下溶液中离子强度较低,上样后,目得物与离子交换剂得结合能力更强,能取代离子而吸附到交换柱上;
1、功能基团得类型决定离子交换剂得类型☆洗脱时,提高溶液离子强度来增强离子得竞争性结合能力,使目得☆功能基团就就是酸性基团-阳离子交换剂物从交换剂上解析☆功能基团就就是碱性基团-阴离子交换剂溶质得电荷性质:蛋白质在离子交换剂上发生吸附就就是因其表面带
2、功能基团得解离性质决定离子交换剂强弱电荷☆强弱不就就是指可交换分子与交换剂结合得牢固程度■蛋白质分子带电基团得来源:特定得氨基酸或蛋白质修饰过☆取决于带电功能基团得pK2(电离平衡常数)强型及弱型离子交换程中引入;剂共性■蛋白质分子所带电荷种类和数量并非常数,与溶液■当层析pH远离pKa时,无论强型还就就是弱型离子交换剂pH直接相关都能牢固吸附可交换分子;pHpI时,蛋白质带净得正电荷■阳离子交换剂应用时有p H下限,低于此pH功能基团开始pHpI时,蛋白质带净得负电荷失去负电荷,强酸型pH下限低于弱酸型;比较样品中目标蛋白和主要杂蛋白得滴定曲线,有助于离子交换层析■弱碱型交换剂应用时有pH上限,高于此pH功能基团开始失起始条件选择去正电荷,李锭基(任何pH都不会失去正电荷)型强碱性■对基本信息不明得蛋白质,常先尝试在略偏碱性条件下采用交换剂无p H上限阴离子交换剂进行层析分离;交换容量:指离子交换剂能结合溶液中可交换离子得能力,常分为总交■Pr样品等电点信息对层析条件选择很有价值,要选择分辨率换容量和有效交换容量较高得层析条件,须获得各组分分子电荷随pH变化得情况
1、总交换容量:指单位质量或体积得离子交换剂中已解离或可能解离(Pr滴定曲线)、得功能基团得总量,其数值大小取决于离子交换剂得取代程度即电荷■P r等电点测定:等电聚焦电泳法密度;基础参数:对某种特定交换剂,其数值恒定■Pr滴定曲线:电泳法
2、实际(有效)交换容量指每克干介质或每毫升湿胶在一定得实蛋白质层析行为验条件下吸附某种分子得实际容量■不仅取决于所带电荷种类和数量☆有效交换容量就就是变值,论及其数值时应同时给出实验条■还与蛋白质分子中电荷分布密切相关件;处于蛋白质分子得内部电荷(她们可能形成盐键维持蛋白质☆单位:g溶质/g IE\g溶质IE得空间结构)对蛋白质层析行为并不产生影响,而取决于蛋白质得表静态容量得测定:试管小样法面电荷■取若干支试管,分别加入相同体积得已用起始缓冲液平衡好层析相关区域蛋白质表面得电荷分布大多不均匀,某些表面区域内得离子交换剂;电荷可能较密集,此区域往往就就就是离子交换时与交换剂发生接触■分别加入一系列不同浓度得Pr溶液,混合振荡确保充分吸得区域,称为层析相关区域,此区域得电性质决定了蛋白质能与何种离附;子交换剂结合■分析上清液中就就是否含P r成分,据能使上清液中无Pr得Z值就就是指蛋白质分子上与离子交换剂发生相互作用得带电位点得最大Pr浓度可推算出每毫升离子交换剂能吸附得P[得上数目进行离子交换层析时限,此即为静态容量■Z值越大,蛋白质与交换剂得结合越牢固动态容量得测定(层析条件下)■Z值越小,蛋白质与交换剂得结合越松弛■取一定体积离子交换剂装柱,用起始缓冲液平衡;Z值就就是多种因子综合作用得平均值■特定流速下加样(样品浓度1〜5m g/mL),不停加■z值与蛋白质净电荷间无直接关系,分子量大得蛋白质与离样至检测出有Pr流出,读数达到最大值一半停止加样(起子交换剂间得接触位点未必多于分子量小得蛋白质;始缓冲液和样品液得读数分别为
0、100%);■蛋白质得构象变化将造成电荷分布情况得改变而引起Z值变■停止加样,用起始缓冲液将不吸附得Pr洗出;■pH影响电性与电量化;■I上升,ot下降,减弱吸附■层析时加样量增加,Z值会下降影响目得物与离子交换剂结合得因素■溶质得电荷分布、IE得电荷分布及位阻效应■溶液p H,她决定了目得物得带电状态■与溶质得浓度成反比■蛋白质得层析相关区域,即电荷在蛋白质表面得分布情况
(2)梯度洗脱:洗脱缓冲液得离子强度或pH连续变化,能获得较■溶液中离子得种类和离子强度高得分辨率pH得影响■峰宽通常小于阶段洗脱■拖尾现象明显改善或完全消除■目得物得pH稳定范围超出此范围会造成目得物活性丧失、■不会造成同一组分被分离称几个峰回收率下降■唐南效应C梯度洗脱得策略离子交换剂表面pH与溶液pH不一致a梯度形状得选择☆阳离子交换剂表面pH比周围缓冲液低1个pH单位■线性梯度:目得物首次分离,Na C10〜
0.5mol/L☆阴离子交换剂表面pH比周围缓冲液高1个pH单位离子种类得影■凸形梯度:梯度末尾部分分辨率不好时使用响■凹形梯度:梯度起始部分分辨率不好时使用■不同离子从离子交换剂上将目得物置换下来得能力不同;■混合梯度■离子类型还对分辨率和不同目得物得洗脱顺序产生影响、☆组分吸附能力相近需改善分辨力得位点提供足够分辨率离子强度得影响☆分辨力不作要求得位点采用陡峭得梯度缩短时间■低离子强度下,目得物通过荷电基团结合至离子交换剂上带b梯度得高度和斜率相反电荷得功能基团上;■较低斜率:吸附能力相近组分间分辨率T,峰宽加大,分离时■竞争离子浓度即溶液离子强度逐渐升高时,目得物逐渐被置间t换下来,绝大多数目得物在Imol/L得盐浓度下能被洗脱■较大斜率:快速分离,尖峰,不同组分得分离度差异减小c流离子交换动力学得五步骤速适当降低流速可提高层析得分辨率
(1)膜扩散:蛋白质通过扩散穿过水膜到达凝胶表面得过程,其速■分离低分子量物质分子扩散速度快,迅速平衡,流速仅受度取决水膜两侧蛋白质得浓度差到介质机械强度、系统压力得限制⑵粒子扩散蛋白质分子进入凝胶颗粒网孔并到达发生交换得位置得■分离生物大分子物质分子:扩散速度慢,达到吸附和解吸平过程衡需一定时间,加样和洗脱过程中流速限制d常用洗脱策略
(3)蛋白质取代离子交换剂上得反离子而发生离子交换;■组分不多,相差较大,用阶段洗脱
(4)被置换下来得反离子扩散到达凝胶颗粒表面,即粒子扩散,方■组分多,相差较大,用简单梯度洗脱向与步骤2相反;■组分复杂,线形洗脱一凸形/凹形洗脱⑸反离子通过扩散穿过水膜到达溶液中,也即膜扩散,方向与步骤1■初次分离,先连续梯度洗脱(确定样品特性和洗脱条件)一相反再阶段洗脱㈠目得物得解离曲线色谱(层析)聚焦Chrom atof ocusing:据生物分子pl得不同,在动已知pl时,一般首先考虑蛋白质得带电情况相中动速不同进行分离(适于水溶性得两性分子)特点:对pl=5得酸性蛋白■DEAE纤维素柱色谱,可选pH
5、5〜
9、0⑴、自动形成pH梯度,不需特殊实验装置;⑵、蛋白质聚焦自身■CM纤维素柱色谱则限于
3、5〜
4、5p I范围,有浓缩效应,峰宽达
0、04-
0、05pH单位,分辨率很高对pl=8得碱性蛋白P B(polybu ffer)-多组分缓冲液:分子量不同得多殿基多氨基化合■CM纤维素柱色谱,可选pH
3、5〜
7、5物(两性电解质性缓冲剂),特点⑴、I不高,但缓冲力强;⑵、缓■DEAE纤维素柱色谱则限于
8、5〜
9、5冲能力就就是均匀得具体还需考虑PBE(polybuffe re xc h ange)一多缓冲交换剂:以交联琼脂糖Seph a⑴目得物得稳定性rose CL-6B为基质,并在糖上通过鞋键偶合上配基而成如低聚乙烯
(2)唐南效应(Do nnan)亚胺要求:确保很宽得pH范围有均衡得缓冲容量色谱(层析)聚焦得应用:蛋白质类(包括酶)得分离;蛋白质类(包括酶)等电点测如阴IE pH表面,pH溶液约1个pH单位定阳IE pH表面vpH溶液约1个pH单位亲和色谱(层析)AC:利用生物分子和其配体之间得特异性生物亲和㈡目得物分子大小力可逆结合得特性而建立得色谱分离方法°㈢其她考虑:吸附选择、流速、经济性、文献影响吸附平衡常数或分布亲和层析得必要条件:合适得配体(配基、1ig and);合适得载体系数a得因素(Ma trix);合适得吸附和洗脱条件配体得选择:
1、考虑亲和势(要求K1在10-4〜10—8mol/L之间);质保留行为
2、与L得偶联不破坏L与S得结合;
3、需了解L-S得作用机制本身就就是酸或碱,同时起维持流动相pH作用作为配体得条件:亲和力大;具有解离平衡;与载体偶联不失活亲和层使用浓度范围
0、01%~
0、1%或10〜100rnmol/L高浓度有机溶析载体得条件
1、亲水;
2、惰性;
3、具有活化基团;
4、大网孔;
5、剂中有足够得溶解度机械性能好对波长>220nm得紫外线没有明显吸收,带芳香环离子对试剂连接臂(Spacer arm):在载体和配基间引入适当长度得“手臂”,减须用荧光、视差折光等检测法少载体得空间阻碍,增加配基得活动度流动相选择须注意问题非专一性洗脱:改变缓冲液得离子强度;改变缓冲液得pH值;改变缓反相层析大多在低pH下运行,加酸调节;冲液得极性;使用洗涤剂;使用促溶盐(cha otropi csal t);使用蛋流动相中添加离子对试剂可改变溶质得保留值和选择性,白质变性剂获得较好得分离效果专一洗脱(亲和洗脱)
(1)使用配体;⑵使用能与配体结合得分子;带正电荷溶质应选带负电荷得离子对试剂三氟乙酸带负电
(3)采用酶促反应得多元专一性洗脱荷溶质应选带正电荷得离子对试剂:季铁盐洗脱应注意得问题洗脱方式总结:
(一)、pH变化(破坏静电引力);
(二)、I变化流动相中有机溶剂种类、pH值、离子对试剂种类等都(减弱静电引力、范德华力);㈢、亲和洗脱;㈣、表面活性剂(减少会对选择性和分辨率产生影响疏水作用、范德华力);㈤、解离试剂(主要破坏氢键,如尿素、盐酸分离低分子量物质时,升高柱温就就是常用得改善分辨率得方法月瓜等);
(六)、降低温度t(较高t吸附、较低t洗脱、减少疏水降低流动相黏度、增加传质速度、减少区带变宽降低流速一定程度上可提高柱效,同时也增加溶质得纵向扩散,过低流速反而造力);
(七)、电泳解吸(在柱两端连上电极进行电泳)成分辨率下降、分离时间延长共价色谱利用形成和破坏共价键能力得差异分离其共价键常为二影响泳动速度了得因素硫键一S—S一,主要用于分离分子中含疏基得Pr、多肽疏水色谱:㈠样品有效迁移率m将疏水得L连到Gel上作用力一蛋白质得疏水区与疏水性配基间形•m就就是表征物质电泳行为得特征值成疏水键可高盐上柱,低盐洗脱或高温上,低温洗•与粒子大小、带电量Q、环境pH、粘度有关金属螯合色谱:His CysTrp能与某些金属离子形成复合物,若将金属
(二)电压(电场强度)离子固定,可将含这些外露AA得Pr吸附蛋白质分子表面得组氨酸•因厂”石,为缩短时间,可提高E咪喳基、半胱氨酸磕基和色氨酸叫味环能与铜、锌、媒离子间形成稳•但高压电泳需解决散热问题定得螯合物洗脱方式:采用增加I或降低pH或加入EDTA o㈢缓冲液(介质液体)有机染料亲和色谱:有机染料如慈酮化合物和偶氮化合物具类似于NAD+得结构一些需核普酸类物质为辅酶得酶,对这些染料具一定
1、p H:主要影响介质带电荷情况(解离度)亲和力
2、«离子强度)应适当
0、01〜
0、3m ol/L亲和层析应用抗体和抗原得纯化;酶得纯化;糖蛋白和脂蛋白得纯化;㈣支持物细胞得纯化
1、吸附作用:造成样品滞留、脱尾反相层析RPC:基于溶质分子与固定相中键合在基质上得疏水性配基
2、电渗:凝胶流汗或变干间得疏水相互作用
3、分子筛效应疏溶剂理论假设反相层析介质表面均匀密集覆盖着非极性配基;溶质分子因受到聚丙烯酰胺Gel㈠合成极性流动相得斥力而以其疏水部分结合至固定相得非极性配基上;除此之外,溶质与固定相间不存在其她任何相互作用原料:丙烯酰胺A cr,双丙烯酰胺Bis亲硅醇基效应
1、化学聚合法硅胶类介质中存在,一定条件下,硅胶表面残余得硅醇基能与溶•催化剂:过硫酸锭(AP)质发生相互作用而对溶质得保留行为起决定作用,此效应常导致•加速剂:N,N,N,N-四甲基乙二胺(T EMED)溶质保留值重复性较差、洗脱峰脱尾等不良层析行为;若硅胶表影响聚合得因素面均匀覆盖非极性配基,对残余硅醇基屏蔽,可基本排除此效应
(1)02会淬灭自由基,需脱气;得影响;新型反相层析介质聚苯乙烯等高分子聚合材料可根本消2加速剂叔胺处在自由碱基状态,需高pH;除亲硅醇基效应得影响⑶温度T,T I,慢;T T,快有机溶剂又称修饰剂(m od ifl er):4避免不纯物得影响作用:降低流动相极性有机玻璃、铁氨化钾等会造成无法聚合要求:能与水互溶;较低得紫外截止波长;较低得黏度Gel要求离子对试剂(i0n pa ir inga gent):•合适得网孔作用通过离子作用与溶质分子结合引起溶质疏水性质改变而调节溶•一定得机械强度凝胶浓度•良好得透明度4“纹理”现象•一定得粘着度•原因:样品中有不溶颗粒农缩效应:电泳时,C1-很快迁移,后面形成低电导区,使G1y、Pr得•措施:增加溶解度,离心除不溶颗粒离子加速,当稳定建立后,在快离子和慢离子之间形成一个迅速移动SDS.聚丙烯酰胺Gel电泳得界面,Pr就聚集在这个移动得界面附近,被浓缩成一个个狭小得中样品中加入含-S-S-还原剂疏基乙醇和二硫苏糖醇,打开Pr分子二间层硫键,使其分解成亚基;样品中加入SDS阴离子洗涤剂,破坏Pr分Natu re PAGE就就是否能测定蛋白质分子量?子氢键和疏水键,使分子去折叠,导致蛋白质构象改变天然PAG E测定蛋白分子量需排除电荷影响,需测量蛋白质分子在不•低离子强度:SDS单体存在,形成P r—SDS复合物同浓度凝胶中相对迁移率•SDS单体浓度>lm0101/匕生成
1、4g SDS/gb先用不同浓度凝胶同时测量未知和已知分子量蛋白质得相对迁蛋白质得柔软棒状物移率;结果导致b对不同蛋白质分子,以其相对迁移率得对数对凝胶浓度作图,⑴复合物带大量负电,掩盖了不同蛋白质分子间原有电荷差异,不同P直线斜率为阻滞系数;r电荷密度相同;b用已知分子量蛋白阻滞系数对其分子量作图得直线,据未知蛋⑵球状Pr呈椭圆棒状雪茄状,无形状差别,棒长度与蛋白质亚基白质阻滞系数从此直线上可查得其分子量双向电泳:采用两种不同分子量有关原理得电泳程序第一向为等电聚焦,第二相为SDS电泳,可使分辨•电泳迁移率仅与蛋白质分子或亚基大小有关率提高几个数量级,并可同时得到等电点和分子量等信息;就就是当•SDS-PAG E:测定蛋白质亚基分子量及鉴定纯度与PAGE得前蛋白质组分析得关键开门技术不同免疫电泳:基于抗原得电泳迁移及抗原与抗体得专一性免疫沉淀反应;
1、SDS得加量抗原起始时带强负电,在凝胶中电泳迁移后与抗体发生免疫反应;最初•凝胶缓冲液中
0、1%SDS抗原过量,产生可溶性免疫混合物而继续向阳极迁移,直至抗原与抗•样品缓冲液中
1、4g SDS/g蛋白质,1〜2%SDS、体得浓度达到当量点,形成不溶性免疫沉淀,沉淀点得高度或面积与1〜6%琉基乙醇或
1、5〜3%DTT、适量溟酚蓝
0、抗原量成正比•电极缓冲液
0、1%SDS蛋白质印迹把从电泳或层析分离得蛋白质转移到固定基质上,并用专一性免疫技术探测固定膜上蛋白质得方法,能更有效分析电泳结果
2、Gel浓度与蛋白质分子量范围毛细管电泳CE:以高压电场为驱动力,以毛细管为分离通道,依据样
3、生物活性得恢复品各组分间迁移率和分配行为上得差异而实现分离得新型得高效液相用弱洗涤剂置换强洗涤剂,从蛋白中去除SDS,许多蛋白可恢复活性或分离技术;可将有生物化学意义得复杂化合物在不改变其性质得前提局部恢复活性下进行分离;应用:蛋白质分离、糖分析、DNA测序、手性分离、单细
4、应用特点胞分离•一次电泳即可得到蛋白质亚基分子量,天然PAGE需多毛细管电泳在蛋白质分析得应用分子量得测定;等电点得测定;肽谱次,简单、经济、快捷、可靠;分析指纹图测定蛋白质一级结构;迁移率得测定⑴敢笑”现象•高分辨率、高重复性,样品用量少且不需纯样;•常在厚胶和垂直电泳中出现•难溶解蛋白SDS-PAGE,已溶解蛋白天然PAGE3“脱尾”现象等电点聚焦电泳IE F:在一种特殊两性电解质两端施加直流电场,可•原因样品溶解不佳,凝胶浓度过高形成线性pH梯度,利用Pr得pl差别,可在其上不同处聚焦分离•措施:加样前离心,选合适缓冲液,加增溶辅助试剂,降低•原因:凝胶中间冷却不均匀2“皱眉”现象•在垂直电泳中可能出现•原因电泳装置不合适,靠近隔板处凝胶未聚合完全或凝胶底部有气泡。
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